Descripción del proyecto
Análisis medioambiental del ADN para la evaluación ambiental de los fondos marinos bentónicos
Medir el impacto humano en los sistemas marinos es crucial, pero evaluar el bioma de aguas profundas plantea retos. La aplicación del análisis medioambiental del ADN aún no está preparada para la integración de políticas. El equipo del proyecto HaploSEA, que cuenta con el apoyo acciones Marie Skłodowska-Curie, evalúa las comunidades bentónicas de aguas profundas a través de la diversidad metagenética. El equipo del proyecto llevará a cabo minuciosos análisis de metabarcodificación de bacterias, arqueas, eucariotas unicelulares y metazoos para explorar las variaciones espaciales y temporales naturales en comunidades enteras. La hibridación capturará material genético para la reconstrucción completa de genes, y se desarrollarán sondas específicas para grupos indicadores bióticos. El equipo del proyecto utilizará la base de datos de metabarcodificación eDNAbyss de Ifremer, muestreará las profundidades marinas a lo largo de un gradiente de perturbación utilizando tecnología submarina avanzada, además de evaluar los métodos y proponer su aplicación para evaluaciones medioambientales.
Objetivo
Measuring anthropogenic impacts on marine systems is of significant interest to stakeholders across the globe. Yet, assessing the ecological status of deep-sea habitats, the earth's largest biome, is challenging. Implementing environmental DNA analysis into environmental policy is desired and timely but not yet ready. HaploSEA is evaluating the use of meta-genetic diversity for biological assessments of deep-sea benthic communities. These include four novel approaches: (I) Performing holistic metabarcoding analyses including bacteria and archaea, unicellular eukaryotes, and metazoans to analyze natural spatial and temporal variability of entire communities. (II) Including haplotype diversity as a new parameter to describe ecosystems. (III) Establish a generic protocol to define genetic indicator groups based on their intraspecific diversity. (IV) Including capture by hybridization, a novel method for full gene reconstruction, and designing specific capture probes for biotic indicator groups of cyanobacteria, foraminifera, and nematodes. For analyses, we will benefit from a unique metabarcoding database (eDNAbyss, Ifremer) with global coverage and 1500 samples from all ocean basins, which are standardized, analyzed, and processed for five-gene regions. Using state-of-the-art underwater technology, we will sample in the deep sea along a disturbance gradient to collect samples for analysis via the above novel approaches. Finally, I will evaluate the suggested approaches and outline their future use for meta-genetic environmental assessments. HaploSEA is an interactive and multidisciplinary project combining expertise and facilities at top European institutes in deep-sea marine science (Ifremer, GEOMAR, and MARUM). This setup combines specialists from different fields, technical backgrounds, and taxonomic groups to share different perspectives and novel approaches.
Ámbito científico
Palabras clave
Programa(s)
- HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA) Main Programme
Régimen de financiación
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European FellowshipsCoordinador
24148 Kiel
Alemania