Elucidating the role of microbial metabolites in stabilising and protecting the leaf microbiome

Projektinformationen

MeStaLeM

ID Finanzhilfevereinbarung: 101108450

DOI

10.3030/101108450

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 3 April 2023

Startdatum 1 Juli 2023

Enddatum 31 Januar 2026

Finanziert unter

• Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)

Gesamtkosten

Keine Daten

EU-Beitrag

€ 173 847,36

Koordiniert durch

EBERHARD KARLS UNIVERSITAET TUEBINGEN
Germany

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Leistungen

Documents, reports (1)

Communication, Dissemination and Exploitation Plan

Plan for the dissemination and exploitation of results, including communication activities submitted at mid-term and an update towards the end of the project.

Data Management Plan (1)

DMP

The Data Management Plan describes the data management life cycle for all data sets that will be collected, processed or generated by the action. It is a document describing what data will be collected, processed or generated and following what methodology and standards, whether and how this data will be shared and/or made open, and how it will be curated and preserved.

Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (8)

Decoding the molecular interplay in the central dogma: An overview of mass spectrometry‐based methods to investigate protein‐metabolite interactions

Autoren: Paolo Stincone, Amira Naimi, Anthony J. Saviola, Raphael Reher, Daniel Petras
Veröffentlicht in: PROTEOMICS, Ausgabe 24, 2025, ISSN 1615-9853
Herausgeber: Wiley
DOI: 10.1002/PMIC.202200533

Metabolomic signatures of pathogen suppression effect of Baltic eelgrass meadows in surrounding seawater

Autoren: Caroline Utermann-Thüsing; Daniel Mendez; Paolo Stincone; Daniel Petras; Deniz Tasdemir
Veröffentlicht in: Science of The Total Environment, 2025, ISSN 1879-1026
Herausgeber: Elsevier
DOI: 10.1016/J.SCITOTENV.2025.179518

Strong pairwise interactions do not drive interactions in a plant leaf associated microbial community

Autoren: Franziska Höhn, Vasvi Chaudhry, Caner Bağci, Maryam Mahmoudi, Elke Klenk, Lara Berg, Paolo Stincone, Chambers C Hughes, Daniel Petras, Heike Brötz-Oesterhelt, Eric Kemen, Nadine Ziemert
Veröffentlicht in: ISME Communications, Ausgabe 5, 2025, ISSN 2730-6151
Herausgeber: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.1093/ISMECO/YCAE117

Offensive role of the <i>Bacillus</i> extracellular matrix in driving metabolite-mediated dialog and adaptive strategies with the fungus <i>Botrytis</i>

Autoren: Alicia I Pérez-Lorente, Carlos Molina-Santiago, David Vela-Corcía, Paolo Stincone, Jesús Hierrezuelo, Montserrat Grifé, Abzer K Pakkir Shah, Antonio de Vicente, Daniel Petras, Diego Romero
Veröffentlicht in: The ISME Journal, Ausgabe 19, 2026, ISSN 1751-7362
Herausgeber: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.1093/ISMEJO/WRAF277

Two-Dimensional Liquid Chromatography Tandem Mass Spectrometry Untangles the Deep Metabolome of Marine Dissolved Organic Matter

Autoren: Stilianos Papadopoulos Lambidis, Tilman Schramm, Karoline Steuer-Lodd, Shane Farrell, Paolo Stincone, Robin Schmid, Irina Koester, Ralph Torres, Thorsten Dittmar, Lihini Aluwihare, Carsten Simon, Daniel Petras
Veröffentlicht in: Environmental Science &amp; Technology, Ausgabe 58, 2025, ISSN 0013-936X
Herausgeber: American Chemical Society (ACS)
DOI: 10.1021/ACS.EST.4C07173

Identifying Quinones in Complex Aqueous Environmental Media (Biochar Extracts) through Tagging with Cysteine and Cysteine-Contained Peptides and High Resolution Mass Spectrometry Analysis

Autoren: Anil Timilsina, Srinidhi Lokesh, Abrar Shahriar, Travis Numan, Tilman Schramm, Paolo Stincone, Laurinda Korang Nyarko, Christian Dewey, Rene Boiteau, Daniel Petras, Yu Yang
Veröffentlicht in: Environmental Science &amp; Technology, Ausgabe 58, 2024, ISSN 0013-936X
Herausgeber: American Chemical Society (ACS)
DOI: 10.1021/ACS.EST.4C04049

Evaluation of Data-Dependent MS/MS Acquisition Parameters for Non-Targeted Metabolomics and Molecular Networking of Environmental Samples: Focus on the Q Exactive Platform

Autoren: Paolo Stincone, Abzer K. Pakkir Shah, Robin Schmid, Lana G. Graves, Stilianos P. Lambidis, Ralph R. Torres, Shu-Ning Xia, Vidit Minda, Allegra T. Aron, Mingxun Wang, Chambers C. Hughes, Daniel Petras
Veröffentlicht in: Analytical Chemistry, Ausgabe 95, 2023, ISSN 0003-2700
Herausgeber: American Chemical Society (ACS)
DOI: 10.1021/ACS.ANALCHEM.3C01202

Statistical analysis of feature-based molecular networking results from non-targeted metabolomics data

Autoren: Abzer K. Pakkir Shah; Axel Walter; Filip Ottosson; Francesco Russo; Marcelo Navarro-Diaz; Judith Boldt; Jarmo-Charles J. Kalinski; Eftychia Eva Kontou; James Elofson; Alexandros Polyzois; Carolina González-Marín; Shane Farrell; Marie R. Aggerbeck; Thapanee Pruksatrakul; Nathan Chan; Yunshu Wang; Magdalena Pöchhacker; Corinna Brungs; Beatriz Cámara; Andrés Mauricio Caraballo-Rodríguez; Andres Cumsille; Fernanda de Oliveira; Kai Dührkop; Yasin El Abiead; Christian Geibel; Lana G. Graves; Martin Hansen; Steffen Heuckeroth; Simon Knoblauch; Anastasiia Kostenko; Mirte C. M. Kuijpers; Kevin Mildau; Stilianos Papadopoulos Lambidis; Paulo Wender Portal Gomes; Tilman Schramm; Karoline Steuer-Lodd; Paolo Stincone; Sibgha Tayyab; Giovanni Andrea Vitale; Berenike C. Wagner; Shipei Xing; Marquis T. Yazzie; Simone Zuffa; Martinus de Kruijff; Christine Beemelmanns; Hannes Link; Christoph Mayer; Justin J. J. van der Hooft; Tito Damiani; Tomáš Pluskal; Pieter Dorrestein; Jan Stanstrup; Robin Schmid; Mingxun Wang; Allegra Aron; Madeleine Ernst; Daniel Petras
Veröffentlicht in: Nature Protocols, 2024, ISSN 1750-2799
Herausgeber: Springer Nature
DOI: 10.1038/S41596-024-01046-3