Objetivo
Human microbiome science is advancing, showing promise of having important impacts on human health with new insights into disease etiology and general human biology. Accordingly, DNA sequencing platforms have been developed rapidly, expanding the scope in microbiome research. Among others, optical mapping technique, capable of imaging single DNA molecules provides access to genetic information on single molecules up to ~1 Mbp in length. It uses fluorescence imaging of linearly stretched DNA molecules labelled at specific sites to probe information patterns along the molecules. The precision of the method is further improved by resolving single molecules below the diffraction limit through super-resolution imaging. However, requirement of large photon budget slows down the speed of imaging, as long acquisitions are required to build up sufficient photons for precise localization. This affects the throughput of DNA optical mapping which involves imaging large areas, thereby limiting its capabilities in providing real-time information of the microbiome on daily basis. Enhancing the emission rates from single molecules can overcome this limitation to permit faster image acquisition. Here we propose to use plasmon-enhanced fluorescence by employing substrate made out of wet-chemically synthesized gold nanotriangles for optical mapping of human gut microbiome. Plasmonic nanostructures can confine incident electromagnetic field into small area near their surface leading to strong light absorption and higher emission rates from fluorophores in their vicinity. The use of wet-chemical plasmonic substrate exhibiting strong plasmon resonance can significantly increase the number of photons released from the labelled DNA, allowing faster image acquisition. With the improved speed, the time required for optical mapping analysis can be significantly shortened, enabling longitudinal metagenomic analysis with practical implications for quicker diagnosis and personalized health care.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias físicas física de la materia condensada cuasipartículas
- ciencias naturales ciencias biológicas genética ADN
- ciencias naturales ciencias físicas óptica microscopía microscopía de superresolución
- ciencias naturales ciencias biológicas microbiología
- ciencias naturales ciencias físicas física teórica física de partículas fotones
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Palabras clave
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
PROGRAMA PRINCIPAL
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
(se abrirá en una nueva ventana) HORIZON-MSCA-2022-PF-01
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
3000 LEUVEN
Bélgica
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.