Objectif
Human microbiome science is advancing, showing promise of having important impacts on human health with new insights into disease etiology and general human biology. Accordingly, DNA sequencing platforms have been developed rapidly, expanding the scope in microbiome research. Among others, optical mapping technique, capable of imaging single DNA molecules provides access to genetic information on single molecules up to ~1 Mbp in length. It uses fluorescence imaging of linearly stretched DNA molecules labelled at specific sites to probe information patterns along the molecules. The precision of the method is further improved by resolving single molecules below the diffraction limit through super-resolution imaging. However, requirement of large photon budget slows down the speed of imaging, as long acquisitions are required to build up sufficient photons for precise localization. This affects the throughput of DNA optical mapping which involves imaging large areas, thereby limiting its capabilities in providing real-time information of the microbiome on daily basis. Enhancing the emission rates from single molecules can overcome this limitation to permit faster image acquisition. Here we propose to use plasmon-enhanced fluorescence by employing substrate made out of wet-chemically synthesized gold nanotriangles for optical mapping of human gut microbiome. Plasmonic nanostructures can confine incident electromagnetic field into small area near their surface leading to strong light absorption and higher emission rates from fluorophores in their vicinity. The use of wet-chemical plasmonic substrate exhibiting strong plasmon resonance can significantly increase the number of photons released from the labelled DNA, allowing faster image acquisition. With the improved speed, the time required for optical mapping analysis can be significantly shortened, enabling longitudinal metagenomic analysis with practical implications for quicker diagnosis and personalized health care.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences physiques physique de la matière condensée quasiparticules
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ADN
- sciences naturelles sciences physiques optique microscopie microscopie à super-résolution
- sciences naturelles sciences biologiques microbiologie
- sciences naturelles sciences physiques physique théorique physique des particules photons
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) HORIZON-MSCA-2022-PF-01
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
3000 LEUVEN
Belgique
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.