Description du projet
Aperçu de l’évolution de la complexité génomique
Les algues brunes se trouvent exclusivement dans les habitats marins et peuvent prendre la forme de petits filaments ou de grandes algues complexes. Elles constituent un excellent modèle génétique pour étudier l’évolution des espèces multicellulaires. Financé par le programme Actions Marie Skłodowska-Curie, le projet PhaeoCREEvol examinera le rôle des éléments cis-régulateurs (CRE pour «cis-regulatory elements») dans l’évolution de la complexité génomique. Les CRE sont des régions d’ADN non codant qui régulent la transcription de gènes spécifiques. Les chercheurs analyseront des ensembles de données multiomiques et les mettront en corrélation avec les CRE spécifiques à chaque lignée et la complexité cellulaire. Les résultats du projet apporteront des informations importantes sur l’évolution des CRE, qui profiteront à la biologie et soutiendront le rôle écologique des algues brunes.
Objectif
Brown algae are a multicellular clade that display remarkable diversity in developmental and physiological complexity, and in life history traits. They evolved independently and more recently than animals and plants, making them a uniquely powerful system to characterise the genomic changes that underlie the emergence of complex multicellularity. I will specifically test the hypothesis that cis-regulatory element (CRE) evolution plays a leading role the evolution of complexity. Harnessing large-scale multiomics datasets, I will quantify lineage-specific rates of CRE gains and losses, and attempt to link these events to transitions in complexity. I will combine signatures of constraint from a 59-species whole-genome alignment with functional epigenomic data (ATAC-seq, ChIP-seq) from five representative species to produce fine-scale maps of deeply conserved and recently acquired CREs.
To understand the mechanisms of CRE evolution, I will annotate transposable elements (TEs) and quantify variation in TE diversity, abundance and activity. I will characterise what roles TEs have had in CRE dissemination. I will also explore between-species variation in the proportion of proximal and distal CREs. I will analyse high-resolution Hi-C data for four species to ask what effect distal regulation has on 3D genome organisation (i.e. are distal CREs and the genes they regulate topologically associated?).
PhaeoCREEvol will inform upon the rates and mechanisms of CRE evolution during the emergence of complexity, providing a highly pertinent comparison to animals and plants. This will increase our knowledge of regulatory evolution in general, while shedding light onto the fundamental biology of a largely unstudied eukaryotic group. Brown algae play critical ecological roles and have significant potential to mitigate climate change, enhance global food security, and deliver novel industrial solutions, providing key motivations to better understand their genetics and evolution.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
La classification de ce projet a été validée par l'équipe qui en a la charge.
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La classification de ce projet a été validée par l'équipe qui en a la charge.
- sciences naturelles sciences biologiques microbiologie phycologie
- sciences médicales et de la santé sciences de la santé nutrition
- sciences naturelles sciences de la Terre et sciences connexes de l'environnement sciences de l'atmosphère climatologie changement climatique
- sciences naturelles sciences biologiques génétique génome
Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) HORIZON-MSCA-2022-PF-01
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
80539 MUNCHEN
Allemagne
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.