Descripción del proyecto
Empleo de datos hologenómicos en la conservación
La diversidad genética es fundamental en la conservación de las especies. Sin embargo, el campo de la genómica de la conservación va a la zaga en el uso eficaz de datos hologenómicos. Aunque las tecnologías de secuenciación del ADN han avanzado mucho, la genómica de la conservación aún no le ha sacado el máximo partido a los datos hologenómicos. En cambio, campos como la genómica humana han desarrollado métodos informáticos para abordar esta carencia. El proyecto ConserVar, que cuenta con el apoyo de las acciones Marie Skłodowska-Curie, pretende colmar esta brecha del conocimiento. Su equipo se centrará en los datos de haplotipos y en la variación genómica estructural para caracterizar la diversidad genética de especies amenazadas. Empleará el zorro ártico como modelo y analizará datos hologenómicos de muestras pasadas y presentes para comprender la estructura poblacional, los cambios temporales en la variación genómica y la adaptación. Esta investigación beneficiará al programa sueco de conservación del zorro ártico.
Objetivo
Genetic diversity is one of the three basic elements of biodiversity. Understanding the full extent of this diversity within species is fundamental for their conservation. However, despite the ongoing advances in DNA sequencing technologies, conservation genomics is lagging behind in using whole-genome data efficiently. In contrast, other fields, such as human genomics, have developed theoretical and computational approaches to tackle this. If applied to endangered species, these approaches will provide a better understanding of their genetic diversity, particularly regarding the structure of this diversity across populations and its effect on adaptation to changing environments.
By leveraging two types of genetic data currently overlooked in conservation genomics haplotype information and structural genomic variation, I will develop new analysis strategies to characterise genomic variation in endangered species. Using the Arctic fox as a model species, I will use whole-genome data from both present-day and historical samples to: 1) infer subtle patterns of population structure and gene flow, 2) quantify temporal changes in genomic structural variation and 3) assess the ability of these types of genetic data to inform on adaptation to local environments.
This research programme will provide not only a comprehensive characterisation of genomic diversity in Arctic foxes with a direct impact on the Swedish Arctic fox conservation programme, but also new analytical tools for conservation genomics, unlocking the full potential of whole-genome data for biodiversity conservation.
Combining my solid track record on both human and biodiversity population genomics, and the hosts extensive expertise on conservation genomics and palaeogenomics, this fellowship will allow me to obtain the key scientific and transferrable skills to establish myself as a research leader in the field and make substantial contributions to biodiversity conservation.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural.
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural.
- ciencias naturalesciencias biológicasgenéticaADN
- ciencias naturalesciencias biológicasconservación de la biodiversidad
- ciencias naturalesciencias biológicasecologíaecosistemas
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Palabras clave
Programa(s)
- HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA) Main Programme
Régimen de financiación
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European FellowshipsCoordinador
10691 Stockholm
Suecia