Projektbeschreibung
Alle genomischen Daten für den Artenschutz einsetzen
Die genetische Vielfalt ist für den Artenschutz von entscheidender Bedeutung, aber die Genomik für den Artenschutz hinkt bei der effektiven Nutzung von allen genomischen Daten hinterher. Während bei DNA-Sequenzierungstechnologien erhebliche Fortschritte erzielt wurden, müssen in der Artenschutzgenomik alle genomischen Daten noch vollständig und effektiv eingesetzt werden. Im Gegensatz dazu wurden in Bereichen wie der Humangenomik rechnerische Ansätze entwickelt, um diese Herausforderung zu bewältigen. Mit Unterstützung der Marie-Skłodowska-Curie-Maßnahmen wird im Projekt ConserVar angestrebt, diese Lücke zu schließen. Mit dem Schwerpunkt auf Haplotypdaten und struktureller genomischer Variation wird die genetische Vielfalt bei gefährdeten Arten charakterisiert. Am Beispiel des Polarfuchses werden alle genomischen Daten aus früheren und heutigen Proben analysiert, um die Populationsstruktur, zeitliche Veränderungen der genomischen Variation und Anpassungen nachzuvollziehen. Diese Forschungsarbeit wird zum schwedischen Programm zum Schutz des Polarfuchses beitragen.
Ziel
Genetic diversity is one of the three basic elements of biodiversity. Understanding the full extent of this diversity within species is fundamental for their conservation. However, despite the ongoing advances in DNA sequencing technologies, conservation genomics is lagging behind in using whole-genome data efficiently. In contrast, other fields, such as human genomics, have developed theoretical and computational approaches to tackle this. If applied to endangered species, these approaches will provide a better understanding of their genetic diversity, particularly regarding the structure of this diversity across populations and its effect on adaptation to changing environments.
By leveraging two types of genetic data currently overlooked in conservation genomics haplotype information and structural genomic variation, I will develop new analysis strategies to characterise genomic variation in endangered species. Using the Arctic fox as a model species, I will use whole-genome data from both present-day and historical samples to: 1) infer subtle patterns of population structure and gene flow, 2) quantify temporal changes in genomic structural variation and 3) assess the ability of these types of genetic data to inform on adaptation to local environments.
This research programme will provide not only a comprehensive characterisation of genomic diversity in Arctic foxes with a direct impact on the Swedish Arctic fox conservation programme, but also new analytical tools for conservation genomics, unlocking the full potential of whole-genome data for biodiversity conservation.
Combining my solid track record on both human and biodiversity population genomics, and the hosts extensive expertise on conservation genomics and palaeogenomics, this fellowship will allow me to obtain the key scientific and transferrable skills to establish myself as a research leader in the field and make substantial contributions to biodiversity conservation.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
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- NaturwissenschaftenBiowissenschaftenErhalt der biologischen Vielfalt
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Schlüsselbegriffe
Programm/Programme
- HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA) Main Programme
Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
(öffnet in neuem Fenster) HORIZON-MSCA-2022-PF-01
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HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF -Koordinator
10691 Stockholm
Schweden