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A Plan towards an eDNA reference library and data repository for Aquatic Organisms, navigating Europe towards the next generation biodiversity monitoring

Description du projet

Approche basée sur l’ADN environnemental pour la stratégie de la Mission Océan de l’UE

L’UE s’est fixé pour objectif de restaurer les océans et les eaux d’ici à 2030. L’analyse de l’ADN environnemental (ADNe) peut jouer un rôle crucial dans la réalisation de cet objectif. Cependant, la mise en œuvre des méthodes basées sur l’ADNe se heurte à des difficultés dues à des bibliothèques de référence incomplètes et déconnectées, ainsi qu’à un manque de métadonnées harmonisées. Le projet eDNAqua-plan, financé par l’UE, s’inscrit dans la stratégie de la Mission Océan de l’UE. Il se concentre sur la collecte d’informations concernant les projets, les initiatives et les infrastructures de surveillance aquatique. Le projet évaluera la faisabilité de l’établissement d’un écosystème numérique de référentiels d’ADNe et d’une bibliothèque de référence des espèces marines et d’eau douce. L’objectif est de soutenir les programmes de surveillance de la biodiversité aquatique et de développer une approche normalisée de la surveillance aquatique à l’aide d’outils d’ADNe.

Objectif

The EU Mission to restore our Oceans and Waters by 2030 relies on robust, reliable and ideally real-time biodiversity data. The analysis of environmental DNA (eDNA) extracted from water or sediment, represents a major source of innovation in aquatic ecosystem monitoring with great potential to support the EU Mission. The central limitation for the routine implementation of eDNA-based methods are incomplete, disconnected and non-standardized reference libraries for taxonomic assignment as well as a lack of harmonised metadata. To support the coordination of the EU Mission Ocean strategy, eDNAqua-Plan will 1) collect information on existing projects, initiatives and infrastructures for aquatic monitoring in the EU and associated countries, 2) provide an overview of all national and international activities of standardization and interoperationalisation of methods and data workflows and 3) assess the relevance and feasibility of the creation of a digital ecosystem of eDNA repositories and an integrated and dynamic reference library of marine and freshwater species that is open-access and based on FAIR principles to support future aquatic biodiversity monitoring programmes and mapping initiatives. The interdisciplinary eDNAqua-Plan consortium comprises 18 partner institutions from 11 countries, and one international (UN) institute, with complementary expertise in marine and freshwater monitoring, eDNA analysis as well as data science. The consortium cooperates with the large EU research projects and infrastructure such as EMODnet, BIOSCAN-Europe, the Ocean and Water knowledge system, LifeWatch, and international systems (ELIXIR/EBI and OBIS) etc. to maximise synergies and interoperability internationally. Possible implementation will be demonstrated by use cases from national and transnational water monitoring programs. Based on this, eDNAqua-Plan will deliver a roadmap for harmonized aquatic monitoring using eDNA tools in Europe and beyond.

Mots‑clés

Coordinateur

EUROPEAN MARINE BIOLOGICAL RESOURCE CENTRE EUROPEAN RESEARCH INFRASTRUCTURE CONSORTIUM
Contribution nette de l'UE
€ 240 625,00
Adresse
4 PLACE JUSSIEU
75005 Paris
France

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Région
Ile-de-France Ile-de-France Paris
Type d’activité
Research Organisations
Liens
Coût total
€ 240 625,00

Participants (17)