Integration of single-cell multi-omics data across space and time to unlock cellular trajectories

Informations projet

MULTIview-CELL

N° de convention de subvention: 101115618

DOI

10.3030/101115618

Date de signature de la CE 28 Septembre 2023

Date de début 1 Avril 2024

Date de fin 31 Mars 2029

Financé au titre de

• European Research Council (ERC)

Coût total

€ 1 285 938,00

Contribution de l’UE

€ 1 285 938,00

Coordonné par

CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE CNRS
France

CORDIS fournit des liens vers les livrables publics et les publications des projets HORIZON.

Les liens vers les livrables et les publications des projets du 7e PC, ainsi que les liens vers certains types de résultats spécifiques tels que les jeux de données et les logiciels, sont récupérés dynamiquement sur OpenAIRE .

Livrables

Data Management Plan (1)

Data Management Plan

Drafting of the Data Management Plan

Publications

Peer reviewed articles (4)

CIRCE: a scalable Python package to predict cis-regulatory DNA interactions from single-cell chromatin accessibility data

Auteurs: Rémi Trimbour, Julio Saez-Rodriguez, Laura Cantini
Publié dans: Bioinformatics, Numéro 42, 2026, ISSN 1367-4811
Éditeur: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.1093/BIOINFORMATICS/BTAG092

STORIES: learning cell fate landscapes from spatial transcriptomics using optimal transport

Auteurs: Geert-Jan Huizing, Jules Samaran, Daniele Capocefalo, Anna Audit, Gabriel Peyré, Laura Cantini
Publié dans: Nature Methods, 2025, ISSN 1548-7091
Éditeur: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/S41592-025-02855-4

Nature Communications

Auteurs: Samaran, Jules; Peyré, Gabriel; Cantini, Laura
Publié dans: Nature Communications, 2024, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1101/2024.02.26.582051

Nature Communications

Auteurs: Jérémie Kalfon; Jules Samaran; Gabriel Peyré; Laura Cantini
Publié dans: Nature Communications, 2024, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature portfolio
DOI: 10.1101/2024.07.29.605556

Conference proceedings (1)

Towards foundation models that learn across biological scales

Auteurs: Jeremie Kalfon, Laura Cantini, Gabriel Peyre
Publié dans: 2026
Éditeur: openRxiv
DOI: 10.1101/2025.05.16.653447