Objetivo
Proteins embedded in membranes play key roles in maintaining cell integrity, homeostasis and communication. Emerging technologies (nanopore sequencing, synthetic cells, …) imitate biological systems and repurpose membrane protein for the transport and sensing of new analytes through synthetic membranes. These applications have fuelled the demand for (synthetic) membrane proteins with properties and functions not observed in nature. Structure-based computational protein design is revolutionizing many aspects of biotechnology but has almost exclusively focused on protein folding in water. The aim of PoreMADNeSS is to develop innovative strategies to enable the design of transmembrane β-barrels (TMBs), a class of membrane proteins with excellent properties to act as nanopore sensors. Using multidisciplinary approaches, we will address basic biophysical knowledge gaps that currently limit TMB design. The design of TMB folding in synthetic membranes gives access to a wealth of TMB sequences and structures not sampled by nature because of constraints associated with biogenesis and with the composition of biomembranes. We propose a combination of massive parallel de novo design and adaptive machine learning to explore this unknown TMB space, to gain crucial insight into the determinants of TMB folding and to develop robust design methods. As a proof-of-concept, PoreMADNeSS will focus on the design of steroid sensing nanopores. Our strategy is to design a cortisol binding site across the transmembrane channel, which would act as the reading head for single molecule fingerprinting. My lab was first to demonstrate the feasibility of TMB design and has established a design pipeline from computation to electrophysiology and biochemical characterization. This project has all the components to translate into transformative advances in nanopore sensing and sequencing by providing the nanopore R&D community with accurate and innovational computational design methodologies.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas bioquímica biomoléculas proteínas
- ciencias médicas y de la salud medicina básica fisiología homeostasis
Para utilizar esta función, debe iniciar sesión o registrarse
Le pedimos disculpas, pero se ha producido un error inesperado durante la ejecución.
Necesita estar autentificado. Puede que su sesión haya finalizado.
Gracias por su comentario. En breve recibirá un correo electrónico para confirmar el envío. Si ha seleccionado que se le notifique sobre el estado del informe, también se le contactará cuando el estado del informe cambie.
Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
-
HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMA PRINCIPAL
Ver todos los proyectos financiados en el marco de este programa
Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
Ver todos los proyectos financiados en el marco de este régimen de financiación
Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
(se abrirá en una nueva ventana) ERC-2023-STG
Ver todos los proyectos financiados en el marco de esta convocatoriaInstitución de acogida
Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
9052 ZWIJNAARDE - GENT
Bélgica
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.