Skip to main content
Przejdź do strony domowej Komisji Europejskiej (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
polski polski
CORDIS - Wyniki badań wspieranych przez UE
CORDIS

Massive parallel de novo design of sensing nanopores

Cel

Proteins embedded in membranes play key roles in maintaining cell integrity, homeostasis and communication. Emerging technologies (nanopore sequencing, synthetic cells, …) imitate biological systems and repurpose membrane protein for the transport and sensing of new analytes through synthetic membranes. These applications have fuelled the demand for (synthetic) membrane proteins with properties and functions not observed in nature. Structure-based computational protein design is revolutionizing many aspects of biotechnology but has almost exclusively focused on protein folding in water. The aim of PoreMADNeSS is to develop innovative strategies to enable the design of transmembrane β-barrels (TMBs), a class of membrane proteins with excellent properties to act as nanopore sensors. Using multidisciplinary approaches, we will address basic biophysical knowledge gaps that currently limit TMB design. The design of TMB folding in synthetic membranes gives access to a wealth of TMB sequences and structures not sampled by nature because of constraints associated with biogenesis and with the composition of biomembranes. We propose a combination of massive parallel de novo design and adaptive machine learning to explore this unknown TMB space, to gain crucial insight into the determinants of TMB folding and to develop robust design methods. As a proof-of-concept, PoreMADNeSS will focus on the design of steroid sensing nanopores. Our strategy is to design a cortisol binding site across the transmembrane channel, which would act as the reading head for single molecule fingerprinting. My lab was first to demonstrate the feasibility of TMB design and has established a design pipeline from computation to electrophysiology and biochemical characterization. This project has all the components to translate into transformative advances in nanopore sensing and sequencing by providing the nanopore R&D community with accurate and innovational computational design methodologies.

Dziedzina nauki (EuroSciVoc)

Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.

Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować

Program(-y)

Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.

Temat(-y)

Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.

System finansowania

Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.

HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants

Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania

Zaproszenie do składania wniosków

Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.

(odnośnik otworzy się w nowym oknie) ERC-2023-STG

Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszenia

Instytucja przyjmująca

VIB VZW
Wkład UE netto

Kwota netto dofinansowania ze środków Unii Europejskiej. Suma środków otrzymanych przez uczestnika, pomniejszona o kwotę unijnego dofinansowania przekazanego powiązanym podmiotom zewnętrznym. Uwzględnia podział unijnego dofinansowania pomiędzy bezpośrednich beneficjentów projektu i pozostałych uczestników, w tym podmioty zewnętrzne.

€ 1 499 250,00
Koszt całkowity

Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.

€ 1 831 287,50

Beneficjenci (1)

Moja broszura 0 0