Description du projet
Faire la lumière sur la régulation post-transcriptionnelle de l’expression des gènes
Les génomes contiennent des gènes qui codent les protéines. L’activité des gènes, et donc l’expression des protéines, est fortement régulée: toutes les cellules n’expriment pas systématiquement toutes les protéines. Il est essentiel de comprendre la manière dont les cellules contrôlent l’activité des gènes pour comprendre leur fonctionnement. Après la transcription d’un gène en ARN, des mécanismes post-transcriptionnels régulent la stabilité de l’ARN et la vitesse à laquelle il est transposé en protéines. Ces étapes très complexes ont été peu étudiées et sont encore largement méconnues. Le projet EPIC, financé par le CER, entend faire la lumière sur la régulation post-transcriptionnelle à l’aide du système de modèle unicellulaire établi, la levure Saccharomyces cerevisiae, et d’autres espèces fongiques eucaryotes. L’équipe fera appel à des technologies à haut débit, à la biologie synthétique et à l’apprentissage profond pour révéler le langage de la régulation des gènes et favoriser la (ré)écriture des génomes.
Objectif
Genomes encode instructions for cells to regulate gene activity in response to their environment. However, and despite its importance for biology, medicine and biotechnology, the underpinning regulatory code remains undeciphered. Gene regulation consists of two major steps. First, genes are transcribed into mRNA. Second, post-transcriptional mechanisms regulate mRNA stability and the rate at which it is translated into proteins. This second step of gene regulation is still poorly understood because relevant parameters such as mRNA half-life, mRNA protein binding and subcellular localization are difficult to assay. The lack of understanding of post-transcriptional regulation implies that we still do not have a complete picture of the regulatory code. In EPIC, we exploit the advantages of the model eukaryote Saccharomyces cerevisiae and other species covering a broad evolutionary range to derive the first comprehensive sequence-based model of eukaryotic gene regulation. EPIC integrates the complementary expertise of 3 teams. It combines innovative high-throughput technologies (Pelechano) to probe post-transcriptional regulation at an unprecedented scale across a broad range of species and conditions with synthetic biology to massively test regulatory sequences (Verstrepen). Deep learning on these data allows us to build predictive models and unravel complex regulatory instructions (Gagneur). Ultimately, EPIC will enable us to decipher the actual language of gene regulation and facilitate (re)writing genomes. EPIC will enable understanding and predicting regulation, and ultimately phenotype, from DNA, closing a major gap in basic biology, while also opening exciting avenues for applications in biotechnology and medicine, from pinpointing disease-causing mutations to rational design of genes, RNAs and cells.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ADN
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines
- sciences naturelles sciences biologiques génétique mutation
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ARN
- sciences naturelles sciences biologiques génétique génome
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMME PRINCIPAL
Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
HORIZON-ERC-SYG - HORIZON ERC Synergy Grants
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2023-SyG
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
9052 ZWIJNAARDE - GENT
Belgique
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.