Unravelling the eukaryotic post-transcriptional regulatory code

Informations projet

EPIC

N° de convention de subvention: 101118521

DOI

10.3030/101118521

Date de signature de la CE 15 Decembre 2023

Date de début 1 Juillet 2024

Date de fin 30 Juin 2030

Financé au titre de

• European Research Council (ERC)

Coût total

€ 9 989 247,00

Contribution de l’UE

€ 9 989 247,00

Coordonné par

VIB VZW
Belgium

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Publications

Peer reviewed articles (3)

Nucleotide dependency analysis of genomic language models detects functional elements

Auteurs: Pedro Tomaz da Silva, Alexander Karollus, Johannes Hingerl, Gihanna Sta. Teresa Galindez, Nils Wagner, Xavier Hernandez-Alias, Danny Incarnato, Julien Gagneur
Publié dans: Nature Genetics, Numéro 57, 2025, ISSN 1061-4036
Éditeur: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/S41588-025-02347-3

scooby: Modeling multi-modal genomic profiles from DNA sequence at single-cell resolution

Auteurs: Johannes C. Hingerl; Laura D. Martens; Alexander Karollus; Trevor Manz; Jason D. Buenrostro; Fabian J. Theis; Julien Gagneur
Publié dans: bioRxiv, 2024, ISSN 2692-8205
Éditeur: Cold Spring Harbor
DOI: 10.1101/2024.09.19.613754

Ribosomes modulate transcriptome abundance via generalized frameshift and out-of-frame mRNA decay

Auteurs: Yujie Zhang, Lilit Nersisyan, Eliska Fürst, Ioannis Alexopoulos, Carlos Santolaria, Susanne Huch, Claudio Bassot, Elena Garre, Per Sunnerhagen, Ilaria Piazza, Vicent Pelechano
Publié dans: Molecular Cell, Numéro 85, 2025, ISSN 1097-2765
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.MOLCEL.2025.04.022