Unravelling the eukaryotic post-transcriptional regulatory code

Información del proyecto

EPIC

Identificador del acuerdo de subvención: 101118521

DOI

10.3030/101118521

Fecha de la firma de la CE 15 Diciembre 2023

Fecha de inicio 1 Julio 2024

Fecha de finalización 30 Junio 2030

Financiado con arreglo a

• European Research Council (ERC)

Coste total

€ 9 989 247,00

Aportación de la UE

€ 9 989 247,00

Coordinado por

VIB VZW
Belgium

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Publicaciones

Peer reviewed articles (6)

Nucleotide dependency analysis of genomic language models detects functional elements

Autores: Pedro Tomaz da Silva, Alexander Karollus, Johannes Hingerl, Gihanna Sta. Teresa Galindez, Nils Wagner, Xavier Hernandez-Alias, Danny Incarnato, Julien Gagneur
Publicado en: Nature Genetics, Edición 57, 2025, ISSN 1061-4036
Editor: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/S41588-025-02347-3

Intron location and sequence modulate gene expression in <i>Yarrowia lipolytica</i>

Autores: Qi Qi, Pedro Tomaz da Silva, Vasileios Vangalis, Seppe Dockx, Jan Steensels, Karin Voordeckers, Julien Gagneur, Kevin J Verstrepen
Publicado en: Nucleic Acids Research, Edición 54, 2026, ISSN 0305-1048
Editor: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.1093/NAR/GKAG650

Flashzoi: an enhanced Borzoi for accelerated genomic analysis

Autores: Johannes C. Hingerl; Alexander Karollus; Julien Gagneur
Publicado en: Bioinformatics, 2025, ISSN 1367-4811
Editor: Oxford Academic
DOI: 10.1101/2024.12.18.629121

Nature Methods

Autores: Johannes C. Hingerl; Laura D. Martens; Alexander Karollus; Trevor Manz; Jason D. Buenrostro; Fabian J. Theis; Julien Gagneur
Publicado en: Nature Methods, 2025, ISSN 1548-7091
Editor: Nature
DOI: 10.1038/S41592-025-02854-5

Current Biology

Autores: Peter W. Bircham; Andrea Del Cortona; Lars Marius Garshol; Mohammed T. Tawfeeq; Beatriz Herrera-Malaver; Sofie Mannaerts; Jeroen Cortebeeck; Robbe Nolmans; Brigida Gallone; Anton Gorkovskiy; Michael Abrouk; Jan Steensels; Kevin J. Verstrepen
Publicado en: Current Biology, 2026, ISSN 0960-9822
Editor: Cell Press
DOI: 10.1016/J.CUB.2026.03.030

Ribosomes modulate transcriptome abundance via generalized frameshift and out-of-frame mRNA decay

Autores: Yujie Zhang, Lilit Nersisyan, Eliska Fürst, Ioannis Alexopoulos, Carlos Santolaria, Susanne Huch, Claudio Bassot, Elena Garre, Per Sunnerhagen, Ilaria Piazza, Vicent Pelechano
Publicado en: Molecular Cell, Edición 85, 2025, ISSN 1097-2765
Editor: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.MOLCEL.2025.04.022