Unravelling the eukaryotic post-transcriptional regulatory code

Projektinformationen

EPIC

ID Finanzhilfevereinbarung: 101118521

DOI

10.3030/101118521

EK-Unterschriftsdatum 15 Dezember 2023

Startdatum 1 Juli 2024

Enddatum 30 Juni 2030

Finanziert unter

• European Research Council (ERC)

Gesamtkosten

€ 9 989 247,00

EU-Beitrag

€ 9 989 247,00

Koordiniert durch

VIB VZW
Belgium

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Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (4)

Nucleotide dependency analysis of genomic language models detects functional elements

Autoren: Pedro Tomaz da Silva, Alexander Karollus, Johannes Hingerl, Gihanna Sta. Teresa Galindez, Nils Wagner, Xavier Hernandez-Alias, Danny Incarnato, Julien Gagneur
Veröffentlicht in: Nature Genetics, Ausgabe 57, 2025, ISSN 1061-4036
Herausgeber: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/S41588-025-02347-3

Flashzoi: an enhanced Borzoi for accelerated genomic analysis

Autoren: Johannes C. Hingerl; Alexander Karollus; Julien Gagneur
Veröffentlicht in: Bioinformatics, 2025, ISSN 1367-4811
Herausgeber: Oxford Academic
DOI: 10.1101/2024.12.18.629121

Nature Methods

Autoren: Johannes C. Hingerl; Laura D. Martens; Alexander Karollus; Trevor Manz; Jason D. Buenrostro; Fabian J. Theis; Julien Gagneur
Veröffentlicht in: Nature Methods, 2025, ISSN 1548-7091
Herausgeber: Nature
DOI: 10.1038/S41592-025-02854-5

Ribosomes modulate transcriptome abundance via generalized frameshift and out-of-frame mRNA decay

Autoren: Yujie Zhang, Lilit Nersisyan, Eliska Fürst, Ioannis Alexopoulos, Carlos Santolaria, Susanne Huch, Claudio Bassot, Elena Garre, Per Sunnerhagen, Ilaria Piazza, Vicent Pelechano
Veröffentlicht in: Molecular Cell, Ausgabe 85, 2025, ISSN 1097-2765
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.MOLCEL.2025.04.022