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CORDIS - Résultats de la recherche de l’UE
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Transcription in 4D: the dynamic interplay between chromatin architecture and gene expression in developing pseudo-embryos

Description du projet

Un «film» de la transcription à plusieurs échelles de temps et d’espace

Au cours du développement des embryons de mammifères, le matériel génétique du noyau, l’ADN et les molécules régulatrices mènent une danse exceptionnellement complexe et bien orchestrée. Les pas de cette danse se déroulent sur des échelles de temps et de distance relativement grandes, et les nuances sont difficiles à enregistrer et à étudier. Le projet DynaTrans, financé par le CER, se propose de combiner de récents outils optiques, moléculaires, génomiques et théoriques appliqués à des pseudo-embryons de mammifères, afin de mettre en lumière les mécanismes dynamiques qui sous-tendent la régulation des gènes au cours du développement. Les travaux incluront le suivi de l’activation transcriptionnelle, des interactions avec l’ADN et de la dynamique de la chromatine en temps réel, ainsi que l’élaboration de modèles mathématiques permettant de saisir simultanément les réarrangements à long terme de la chromatine et les mouvements à court terme des éléments de régulation génétique et de l’activité transcriptionnelle.

Objectif

During mammalian embryogenesis, key events involving DNA and regulatory molecules over seconds and nanometers affect and are affected by, a major reorganization of the genetic material in the nucleus over hours and micrometers. How these scales are spanned and integrated into the course of development remains a major unresolved challenge. Progress in this quest is difficult, either because current model systems suffer from severe technical limitations or because existing analytical approaches probe individual spatial or temporal scales thus ignoring their evolving interactions. Traditional live imaging lacks the spatial resolution to accurately delineate chromosome organization at the scale of genes, while bulk molecular assays are ill-suited for studying development over time. Here, we propose a multi-disciplinary approach to the dynamics of developmental gene regulation to understand the details of the underlying mechanisms and their deployment over time. We combine and apply optical, molecular-genomic, and theoretical tools to recently available mammalian pseudo-embryos, allowing unprecedented precision in developmental staging, a large amount of material, and easy optical access. By focusing on select gene loci we track transcriptional activation and the interactions of distal DNA elements in real-time along with the associated chromatin dynamics using interaction profiles. Our datasets are iteratively distilled into mathematical models of increasing scope, converging towards an integrative dynamic polymer model that simultaneously captures long-timescale chromatin rearrangements as well as short-timescale motions of genetic regulatory elements and transcriptional activity. We then challenge these models via genome editing and temporally defined interventions by building light-controlled tools to affect the chromosome landscape. This project aims to reshape our view of how genes are regulated during mammalian development.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.

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Mots‑clés

Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).

Programme(s)

Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

HORIZON-ERC-SYG - HORIZON ERC Synergy Grants

Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme de financement

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2023-SyG

Voir tous les projets financés au titre de cet appel

Institution d’accueil

INSTITUT PASTEUR
Contribution nette de l'UE

La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.

€ 4 057 036,25
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

€ 4 057 036,25

Bénéficiaires (3)

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