Projektbeschreibung
Transkriptions-„Film“ über mehreren Ebenen von Raum und Zeit
Bei der Entwicklung von Säugetierembryonen findet ein außergewöhnlich komplexer und gut orchestrierter Tanz statt, an dem das genetische Material im Zellkern, die DNS, und regulatorische Moleküle beteiligt sind. Die Schritte dieses Tanzes erstrecken sich über relativ große Zeit- und Entfernungsmaßstäbe, und die Nuancen sind schwierig aufzuzeichnen und zu erforschen. Das Ziel des ERC-finanzierten Projekts DynaTrans besteht darin, optische, molekulargenomische und theoretische Instrumente zu kombinieren, die auf neuerdings verfügbare Pseudo-Embryonen von Säugetieren angewandt werden, um die der Genregulierung während der Entwicklung zugrunde liegenden dynamischen Mechanismen ans Licht zu bringen. Die Arbeiten werden die Nachverfolgung der Transkriptionsaktivierung, der DNS-Wechselwirkungen und der Chromatindynamik in Echtzeit sowie die Entwicklung mathematischer Modelle zur gleichzeitigen Erfassung von Chromatinumlagerungen in langen Zeiträumen und Bewegungen genetischer Regulierungselemente in kurzen Zeiträumen und der Transkriptionsaktivität umfassen.
Ziel
During mammalian embryogenesis, key events involving DNA and regulatory molecules over seconds and nanometers affect and are affected by, a major reorganization of the genetic material in the nucleus over hours and micrometers. How these scales are spanned and integrated into the course of development remains a major unresolved challenge. Progress in this quest is difficult, either because current model systems suffer from severe technical limitations or because existing analytical approaches probe individual spatial or temporal scales thus ignoring their evolving interactions. Traditional live imaging lacks the spatial resolution to accurately delineate chromosome organization at the scale of genes, while bulk molecular assays are ill-suited for studying development over time. Here, we propose a multi-disciplinary approach to the dynamics of developmental gene regulation to understand the details of the underlying mechanisms and their deployment over time. We combine and apply optical, molecular-genomic, and theoretical tools to recently available mammalian pseudo-embryos, allowing unprecedented precision in developmental staging, a large amount of material, and easy optical access. By focusing on select gene loci we track transcriptional activation and the interactions of distal DNA elements in real-time along with the associated chromatin dynamics using interaction profiles. Our datasets are iteratively distilled into mathematical models of increasing scope, converging towards an integrative dynamic polymer model that simultaneously captures long-timescale chromatin rearrangements as well as short-timescale motions of genetic regulatory elements and transcriptional activity. We then challenge these models via genome editing and temporally defined interventions by building light-controlled tools to affect the chromosome landscape. This project aims to reshape our view of how genes are regulated during mammalian development.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik DNS
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Entwicklungsbiologie
- Naturwissenschaften Chemiewissenschaften Polymerwissenschaft
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik Chromosom
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik Genom
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Schlüsselbegriffe
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
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Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
HAUPTPROGRAMM
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
HORIZON-ERC-SYG - HORIZON ERC Synergy Grants
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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
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(öffnet in neuem Fenster) ERC-2023-SyG
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Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.
75724 Paris
Frankreich
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.