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The role of the gut microbiome in host responses to environmental variation: within and across generations and species

Description du projet

La contribution de microbiome intestinal des oiseaux à leur adaptation au climat

Le microbiome intestinal joue un rôle crucial dans le maintien de la santé, la plupart des recherches se limitent toutefois à des modèles animaux de laboratoire. Une parfaite compréhension de la fonction du microbiome exige de disposer de données provenant de populations et d’espèces sauvages. Dans cette optique, le projet MiMeRe, financé par le CER, étudie la manière dont le microbiome intestinal des oiseaux sauvages s’adapte aux variations de température induites par le changement climatique. Le projet s’est fixé plusieurs objectifs, notamment élucider la manière dont le microbiome influence la réponse de l’hôte aux fluctuations de température, examiner les modifications épigénétiques sous-jacentes et analyser les mécanismes moléculaires des interactions entre l’hôte et le microbiome. Il fera appel à des techniques avancées telles que les transplantations de microbiomes, la génétique quantitative et les modèles phylogénétiques multivariés, pour étudier le rôle causal des microbiomes dans ces processus.

Objectif

The gut microbiome is strongly linked to health and sickness. A current key challenge is to understand how the microbiome helps the host adapt to environmental variation. Yet, most research originates from few laboratory animal models and thus misses large parts of environmental, physiological and life-history variation, while data from wild populations and species is needed. Thus, our overarching aim is to unravel how the microbiome mediates hosts responses to environmental variation, covering molecular to evolutionary scale, using wild birds as a study system. We focus on how gut microbiome helps hosts to cope with temperature variation, given the pervasiveness of temperature as a challenge across taxa, and climate-crisis driven thermal challenges. The objectives:

(O1) To study the role of the microbiome in mediating host (adaptive) reversible thermal plasticity in adulthood
(O2) To assess the role of the microbiome in mediating host (adaptive) developmental and transgenerational thermal plasticity, and explore the underlying epigenetic changes
(O3) To quantify the contribution of host genetic variation and the microbiome on host thermal physiology
(O4) To explore the macroevolutionary patterns of microbiome and host thermal physiology
(O5) To examine the underlying molecular mediators of host-microbiome interactions

To understand the causal role of microbiome, we apply state-of-the-art methods (incl. microbiome transplants) within and across populations (O1) and generations (O2), and identify the molecular mediators (incl. bacterial vesicles; O5), many tools adapted from the biomedical field to eco-evo research. We further use quantitative genetics, reaction norms, selection lines (O3) and multivariate phylogenetic models (O4), rarely used in host-microbiome field, opening new lines of research. We produce ground-breaking findings on the microbiome-mediated mechanisms of phenotypic variation, which helps to predict how organisms respond to anthropog

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.

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Régime de financement

HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants

Institution d’accueil

JYVASKYLAN YLIOPISTO
Contribution nette de l'UE
€ 1 999 943,00

Bénéficiaires (1)