Projektbeschreibung
Arzneimittelresistenz in Tumoren verstehen
Tumore entwickeln sich von heilbaren Krankheiten im frühen Stadium zu behandlungsresistenten Krebsarten, sodass Therapieresistenz in der Onkologie eine große Herausforderung darstellt. Vermutlich ist ein Großteil der Resistenz auf erbliche epigenetische Veränderungen in Krebszellen zurückführen, die oft als „dunkle Materie“ der Krebsevolution bezeichnet werden. Diese genetischen und epigenetischen Anpassungen können gleichzeitig innerhalb desselben Tumors auftreten. Durch einen Mangel an Wissen zu diesen Mechanismen können keine neuen Behandlungen entwickelt werden. Im ERC-finanzierten Projekt DARC MATTER wird die Arzneimittelresistenz bei Darmkrebs erforscht. Anhand von patientenabgeleiteten Organoidmodellen wird das Team untersuchen, wie diese Organoide sich bei Krebsbehandlung entwickeln. Mit fortschrittlichen Verfahren werden neue Resistenzmechanismen bestimmt und Vorhersagemodelle entwickelt, um letztendlich Strategien zur Wirkstoffkombination und Behandlungsergebnisse zu verbessern.
Ziel
Tumours evolve, transforming from early-stage curable disease into treatment-refractory, deadly cancer. Therapy resistance is arguably the biggest problem in oncology today, and much of it remains unexplained.
The central hypothesis of this proposal is that a large proportion of unexplained drug resistance is due to heritable epigenetic alterations, and non-heritable transcriptional plasticity in cancer cells. I refer to these mechanisms as the dark matter of cancer evolution. Genetic, epigenetic and transcriptional adaptation, together with changes in the tumour microenvironment, may happen at the same time in the same tumour. Lack of knowledge of these mechanisms hinders the development of new treatments strategies. Tackling drug resistance requires a unique combination of clinical cohorts, experimental models, evolutionary biology and computational methods.
I will map and quantify the mechanisms and evolutionary dynamics of genetic and non-genetic drug resistance at unprecedented scale. I will focus on colorectal cancer, the third most common cancer and second leading cause of cancer-related death worldwide. I will use patient-derived organoid models, matched to clinical cohorts followed longitudinally. I will measure organoid evolution under the pressure of cancer drugs, with and without the tumour microenvironment. I will track cell lineages with lentiviral barcoding and perform longitudinal single cell multi-omics, measuring genomes, epigenomes and transcriptomes of the same cell. I will interpret the results within a unique computational framework that brings together evolutionary theory with machine learning to measure, predict and control resistance.
This project will identify new mechanisms and dynamics of cancer drug resistance, deliver new predictive models, and find novel collateral drug sensitivities. This will allow designing rational drug combinations and schedules that will prevent or delay resistance, drastically improving patient outcome.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
- Medizin- und Gesundheitswissenschaften Grundlagenmedizin Pharmakologie und Pharmazie Arzneimittelresistenz
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik RNS Transkriptome
- Medizin- und Gesundheitswissenschaften Klinische Medizin Onkologie
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik Epigenetik Epigenome
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik Genom
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Schlüsselbegriffe
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
HAUPTPROGRAMM
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
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(öffnet in neuem Fenster) ERC-2023-COG
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Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.
20157 Milano
Italien
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.