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Dynamics of Adaptation and Resistance in Cancer: MApping and conTrolling Transcriptional and Epigenetic Recurrence

Descrizione del progetto

Comprendere la farmacoresistenza nei tumori

I tumori si trasformano da malattie curabili in fase iniziale in cancri resistenti ai trattamenti, e la resistenza alle terapie rappresenta una sfida importante in oncologia. Si ritiene che gran parte di questa resistenza derivi da cambiamenti epigenetici ereditabili nelle cellule tumorali, spesso indicati come la «materia oscura» dell’evoluzione del cancro. Questi adattamenti genetici ed epigenetici possono verificarsi contemporaneamente all’interno dello stesso tumore. Tuttavia, la comprensione limitata di questi meccanismi ostacola lo sviluppo di nuovi trattamenti. Il progetto DARC MATTER, finanziato dal CER, mira a esplorare la farmacoresistenza nel cancro del colon-retto. Utilizzando modelli di organoidi derivati da pazienti, il progetto studierà come questi organoidi si evolvono durante il trattamento del cancro. Saranno impiegate tecniche avanzate per individuare nuovi meccanismi di resistenza e sviluppare modelli predittivi, migliorando in definitiva le strategie di combinazione dei farmaci e gli esiti per i pazienti.

Obiettivo

Tumours evolve, transforming from early-stage curable disease into treatment-refractory, deadly cancer. Therapy resistance is arguably the biggest problem in oncology today, and much of it remains unexplained.

The central hypothesis of this proposal is that a large proportion of unexplained drug resistance is due to heritable epigenetic alterations, and non-heritable transcriptional plasticity in cancer cells. I refer to these mechanisms as the dark matter of cancer evolution. Genetic, epigenetic and transcriptional adaptation, together with changes in the tumour microenvironment, may happen at the same time in the same tumour. Lack of knowledge of these mechanisms hinders the development of new treatments strategies. Tackling drug resistance requires a unique combination of clinical cohorts, experimental models, evolutionary biology and computational methods.

I will map and quantify the mechanisms and evolutionary dynamics of genetic and non-genetic drug resistance at unprecedented scale. I will focus on colorectal cancer, the third most common cancer and second leading cause of cancer-related death worldwide. I will use patient-derived organoid models, matched to clinical cohorts followed longitudinally. I will measure organoid evolution under the pressure of cancer drugs, with and without the tumour microenvironment. I will track cell lineages with lentiviral barcoding and perform longitudinal single cell multi-omics, measuring genomes, epigenomes and transcriptomes of the same cell. I will interpret the results within a unique computational framework that brings together evolutionary theory with machine learning to measure, predict and control resistance.

This project will identify new mechanisms and dynamics of cancer drug resistance, deliver new predictive models, and find novel collateral drug sensitivities. This will allow designing rational drug combinations and schedules that will prevent or delay resistance, drastically improving patient outcome.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Parole chiave

Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).

Programma(i)

Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo schema di finanziamento

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

(si apre in una nuova finestra) ERC-2023-COG

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito del bando

Istituzione ospitante

FONDAZIONE HUMAN TECHNOPOLE
Contributo netto dell'UE

Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.

€ 1 995 582,00
Indirizzo
VIALE LEVI MONTALCINI RITA 1
20157 Milano
Italia

Mostra sulla mappa

Regione
Nord-Ovest Lombardia Milano
Tipo di attività
Research Organisations
Collegamenti
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

€ 1 995 582,00

Beneficiari (1)

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