Descripción del proyecto
Innovadora tecnología para descifrar el ARN
El ARN tiene un papel vital en las interacciones moleculares de todas las formas de vida y es esencial para mantener la homeostasis celular. Sus redes complejas, espaciales y dinámicas son fundamentales en numerosos procesos biológicos, y las alteraciones en los interactomas de ARN se relacionan con diversas enfermedades humanas. Pese a la investigación sobre el ARN, los avances en el descubrimiento y la caracterización de las interacciones del ARN a nivel del transcriptoma han sido lentos. El proyecto RNAPhotoCat, financiado por el Consejo Europeo de Investigación, pretende abordar el reto desarrollando una tecnología rentable, de alta precisión, sencilla y versátil. Mediante aptámeros biRhoBAST y etiquetado fotocatalítico de proximidad, la tecnología permitirá identificar con precisión las interacciones ARN-ARN y ARN-proteína. Se espera que ello mejore nuestra comprensión de los interactomas de ARN, allanando el camino para avances fundamentales en numerosos campos.
Objetivo
RNA is a fundamental component of life. Complex, dynamic, and spatial networks of molecular interactions between RNAs and other biomolecules are essential for maintaining cellular homeostasis. Disruptions in the RNA interactome have been linked to a number of human diseases, implying that these molecular interactions could represent a new family of unexploited therapeutic targets. Despite the growing appreciation of the importance of RNA, discovery, and characterization of RNA interactions at the transcriptome level is lagging behind, mainly due to the limitations of the existing methods including low precision, low throughput, low coverage, biased analysis, complicated protocols involving cumbersome biochemical fractionation or cell-line engineering. With the present technology, many more years may pass before a comprehensive list of their functions, localizations, and interactions can be assembled, considering the immense size and complexity of the human transcriptome and RNA interactome.
This ERC project aims to establish a simple, versatile, and low-cost technology based-on photocatalytic proximity-labeling and the biRhoBAST aptamer for deciphering RNA-RNA and RNA-protein interactions with high precision for any given RNA at different resolutions, ranging from single-molecule to macromolecular complex level. Owing to its innovative design, this technology will seamlessly integrate with advanced super-resolution RNA imaging techniques, providing valuable insights into the intricate interaction networks of RNA with high temporal and spatial resolution. By applying this massively multiplexable technology to numerous biological settings and disease-related RNAs, we will expand our understanding of interactomes, uncover new insights into subcellular RNA structures and unravel fundamental molecular mechanisms of RNA diseases, leading to the discovery of novel functions for both RNA and proteins, and potentially unlocking new therapeutic targets.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural.
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Palabras clave
Programa(s)
- HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC) Main Programme
Régimen de financiación
HORIZON-ERC - HORIZON ERC GrantsInstitución de acogida
69117 Heidelberg
Alemania