Projektbeschreibung
Innovative Technologie zur Entschlüsselung von RNA
RNA ist wichtig für molekulare Wechselwirkungen in allen Lebensformen und entscheidend für die Aufrechterhaltung der zellulären Homöostase. Die komplexen, räumlichen und dynamischen Netze sind der Schlüssel zu zahlreichen biologischen Prozessen. Störungen der RNA-Interaktome stehen mit vielen menschlichen Krankheiten in Verbindung. Trotz der Forschung zu RNA wurden nur langsam Fortschritte bei der Entdeckung und Charakterisierung von RNA-Interaktionen auf Ebene der Transkriptome erreicht. Diese Herausforderung wird im ERC-finanzierten Projekt RNAPhotoCat mit einer kosteneffizienten, hochpräzisen, einfachen und vielseitigen Technologie bewältigt. Mit biRhoBAST-Aptameren und photokatalytischer Proximity-Markierung ist mit der Technologie die präzise Bestimmung von Wechselwirkungen zwischen RNA und RNA mit Proteinen möglich. So kann das Wissen zu den RNA-Interaktomen vertieft und der Weg für kritische Fortschritte in zahlreichen Bereichen bereitet werden.
Ziel
RNA is a fundamental component of life. Complex, dynamic, and spatial networks of molecular interactions between RNAs and other biomolecules are essential for maintaining cellular homeostasis. Disruptions in the RNA interactome have been linked to a number of human diseases, implying that these molecular interactions could represent a new family of unexploited therapeutic targets. Despite the growing appreciation of the importance of RNA, discovery, and characterization of RNA interactions at the transcriptome level is lagging behind, mainly due to the limitations of the existing methods including low precision, low throughput, low coverage, biased analysis, complicated protocols involving cumbersome biochemical fractionation or cell-line engineering. With the present technology, many more years may pass before a comprehensive list of their functions, localizations, and interactions can be assembled, considering the immense size and complexity of the human transcriptome and RNA interactome.
This ERC project aims to establish a simple, versatile, and low-cost technology based-on photocatalytic proximity-labeling and the biRhoBAST aptamer for deciphering RNA-RNA and RNA-protein interactions with high precision for any given RNA at different resolutions, ranging from single-molecule to macromolecular complex level. Owing to its innovative design, this technology will seamlessly integrate with advanced super-resolution RNA imaging techniques, providing valuable insights into the intricate interaction networks of RNA with high temporal and spatial resolution. By applying this massively multiplexable technology to numerous biological settings and disease-related RNAs, we will expand our understanding of interactomes, uncover new insights into subcellular RNA structures and unravel fundamental molecular mechanisms of RNA diseases, leading to the discovery of novel functions for both RNA and proteins, and potentially unlocking new therapeutic targets.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
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Schlüsselbegriffe
Programm/Programme
- HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC) Main Programme
Thema/Themen
Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
(öffnet in neuem Fenster) ERC-2023-COG
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