Global Amyloid Mapping: Solving Amyloid Nucleation by Deep Mutagenesis

Informations projet

GLAM-Map

N° de convention de subvention: 101125484

DOI

10.3030/101125484

Date de signature de la CE 14 Février 2024

Date de début 1 Mai 2024

Date de fin 30 Avril 2029

Financé au titre de

• European Research Council (ERC)

Coût total

€ 1 999 008,00

Contribution de l’UE

€ 1 999 008,00

Coordonné par

FUNDACIO INSTITUT DE BIOENGINYERIA DE CATALUNYA
Spain

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Publications

Peer reviewed articles (6)

Massive mutagenesis reveals an incomplete amyloid motif in Bri2 that turns amyloidogenic upon C-terminal extension

Auteurs: Mariano Martín, Benedetta Bolognesi
Publié dans: Proceedings of the National Academy of Sciences, Numéro 122, 2025, ISSN 0027-8424
Éditeur: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/PNAS.2415521122

Massive experimental quantification allows interpretable deep learning of protein aggregation

Auteurs: Mike Thompson, Mariano Martín, Trinidad Sanmartín Olmo, Chandana Rajesh, Peter K. Koo, Benedetta Bolognesi, Ben Lehner
Publié dans: Science Advances, Numéro 11, 2025, ISSN 2375-2548
Éditeur: American Association for the Advancement of Science (AAAS)
DOI: 10.1126/SCIADV.ADT5111

An atlas of amyloid aggregation: the impact of substitutions, insertions, deletions and truncations on amyloid beta fibril nucleation

Auteurs: Mireia Seuma, Ben Lehner, Benedetta Bolognesi
Publié dans: Nature Communications, Numéro 13, 2022, ISSN 2041-1723
Éditeur: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/S41467-022-34742-3

Minimum information and guidelines for reporting a multiplexed assay of variant effect

Auteurs: Melina Claussnitzer, Victoria N. Parikh, Alex H. Wagner, Jeremy A. Arbesfeld, Carol J. Bult, Helen V. Firth, Lara A. Muffley, Alex N. Nguyen Ba, Kevin Riehle, Frederick P. Roth, Daniel Tabet, Benedetta Bolognesi, Andrew M. Glazer, Alan F. Rubin
Publié dans: Genome Biology, Numéro 25, 2024, ISSN 1474-760X
Éditeur: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1186/S13059-024-03223-9

Massively parallel quantification of mutational impact on IAPP amyloid formation

Auteurs: Marta Badia, Cristina Batlle, Benedetta Bolognesi
Publié dans: Nature Communications, Numéro 17, 2026, ISSN 2041-1723
Éditeur: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/S41467-026-70611-Z

Massively parallel genetic perturbation suggests the energetic structure of an amyloid-β transition state

Auteurs: Anna Arutyunyan, Mireia Seuma, Andre J. Faure, Benedetta Bolognesi, Ben Lehner
Publié dans: Science Advances, Numéro 11, 2025, ISSN 2375-2548
Éditeur: American Association for the Advancement of Science (AAAS)
DOI: 10.1126/SCIADV.ADV1422