Descripción del proyecto
Alta resolución transcriptómica espacial de bajo coste
La transcriptómica espacial permite a los científicos analizar la expresión génica en los tejidos con notable precisión, poniendo de manifiesto cómo se distribuyen los genes en las distintas regiones. Sin embargo, la tecnología sigue siendo cara e inaccesible, lo cual limita su uso principalmente a la investigación de bajo rendimiento. Los métodos actuales implican procesos complejos y costosos, como la impresión de identificadores de dirección únicos en las superficies o la utilización de microscopía para la secuenciación, que aumentan los costes y el tiempo. En consecuencia, las aplicaciones más amplias en diagnósticos y análisis de alto rendimiento siguen estando fuera de su alcance. En este contexto, el proyecto MESH CHIP, financiado por el Consejo Europeo de Investigación, pretende introducir una plataforma de bajo coste y alta resolución. En concreto, emplea el autoensamblaje y la reconstrucción computacional, reduciendo costes y mejorando el rendimiento. En general, permite un mayor rendimiento y ofrece nuevas posibilidades en el análisis de tejidos.
Objetivo
We propose a technology platform for low cost, high resolution spatial transcriptomics surfaces. Spatial transcriptomics is a high cost research methodology for resolving the spatial variation of genes in a tissue by capturing mRNA transcripts on a surface containing molecular address markers. To produce these surfaces, current methods rely on either printing technology with explicit assignment of unique address ID's to spatial locations or else random scattering of molecular ID's that are then sequenced in situ using microscopy. Both of these fabrication methods are prohibitively expensive and time consuming, such that spatial transcriptomic technology is still limited to a narrow selection of low throughput research applications. Our proposed technology, the MESH CHIP represents a radically different approach to producing these surfaces. Rather than print surfaces or build sequence-address maps with in situ microscopy, our technology works by self-assembly and deduction from sequencing data alone. This means that no prior information about the identity or location of address markers on the surface is needed prior to mRNA capture and sequencing. Instead, this information is reconstructed computationally using graph theory in a post hoc fashion. By moving this information roadblock in the fabrication process to the increasingly cheap sequencing and computing stage, we greatly improve the cost performance of this technology. MESH CHIP technology would represent a qualitatively lower cost product with greater performance than the state of the art, unlocking new use cases like diagnostics and high throughput tissue processing.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMA PRINCIPAL
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
HORIZON-ERC-POC - HORIZON ERC Proof of Concept Grants
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
(se abrirá en una nueva ventana) ERC-2023-POC
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
100 44 STOCKHOLM
Suecia
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.