Description du projet
Une transcriptomique spatiale à haute résolution et à faible coût
La transcriptomique spatiale permet aux scientifiques d’analyser l’expression génétique dans les tissus avec une précision remarquable, révélant la répartition des gènes sur différentes régions. Cette technologie demeure toutefois coûteuse et inaccessible, ce qui limite son utilisation principalement à la recherche à faible débit. Les méthodes actuelles impliquent des processus complexes et coûteux, tels que l’impression d’identifiants d’adresses uniques sur les surfaces ou l’utilisation de la microscopie pour le séquençage, qui augmentent tous deux les coûts et les délais. Des applications plus larges dans le domaine du diagnostic et de l’analyse à haut débit demeurent par conséquent hors de portée. Dans ce contexte, le projet MESH CHIP, financé par le CE, entend créer une plateforme à haute résolution et à faible coût. Plus précisément, elle utilise l’auto-assemblage et la reconstruction informatique, réduisant les coûts et améliorant les performances. Globalement, la plateforme permettra un débit plus élevé et ouvre de nouvelles possibilités d’analyse des tissus.
Objectif
We propose a technology platform for low cost, high resolution spatial transcriptomics surfaces. Spatial transcriptomics is a high cost research methodology for resolving the spatial variation of genes in a tissue by capturing mRNA transcripts on a surface containing molecular address markers. To produce these surfaces, current methods rely on either printing technology with explicit assignment of unique address ID's to spatial locations or else random scattering of molecular ID's that are then sequenced in situ using microscopy. Both of these fabrication methods are prohibitively expensive and time consuming, such that spatial transcriptomic technology is still limited to a narrow selection of low throughput research applications. Our proposed technology, the MESH CHIP represents a radically different approach to producing these surfaces. Rather than print surfaces or build sequence-address maps with in situ microscopy, our technology works by self-assembly and deduction from sequencing data alone. This means that no prior information about the identity or location of address markers on the surface is needed prior to mRNA capture and sequencing. Instead, this information is reconstructed computationally using graph theory in a post hoc fashion. By moving this information roadblock in the fabrication process to the increasingly cheap sequencing and computing stage, we greatly improve the cost performance of this technology. MESH CHIP technology would represent a qualitatively lower cost product with greater performance than the state of the art, unlocking new use cases like diagnostics and high throughput tissue processing.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
HORIZON-ERC-POC - HORIZON ERC Proof of Concept Grants
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2023-POC
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
100 44 STOCKHOLM
Suède
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.