Description du projet
Découvrir les secrets de l’évolution de l’épigénome des plantes cultivées
Les plantes cultivées sont essentielles pour la sécurité alimentaire mondiale, mais nous manquons d’informations sur leur diversité génétique. La méthylation de l’ADN, un mécanisme épigénétique clé, joue un rôle essentiel dans la réaction des plantes au stress environnemental et leur évolution au fil du temps. Soutenu par le programme Actions Marie Skłodowska-Curie, le projet mC-EVOLVE cherche à découvrir les principes évolutifs qui régissent la diversité de la méthylation des plantes cultivées. En intégrant la modélisation mathématique, la génétique des populations et l’épigénétique, mC-EVOLVE vise à démêler les influences évolutives et environnementales sur la méthylation, à évaluer la stabilité des schémas de méthylation d’une génération à l’autre, et à quantifier les forces évolutives dans différentes plantes cultivées. Ces travaux pourraient ouvrir de nouvelles voies pour améliorer la résilience et l’adaptabilité des cultures, ce qui est important pour l’innovation agricole future.
Objectif
In this project, mC-EVOLVE, I aim to decipher the evolutionary principles governing crop plant methylation diversity. This newfound knowledge will unlock investigations into an underexplored source of functional variation. The project employs a multidisciplinary approach that encompasses mathematical modeling, population genetics, and epigenetics. It is structured around three main objectives:
Objective 1 - Separation of Evolutionary and Environmental Forces on Methylomes: I will develop an innovative inference tool to disentangle neutral, selective, and environmental influences on methylation variants. This will be achieved by inferring the genealogy along the methylome and evaluating the local correlations between genetic and methylation variants.
Objective 2 - Assessment of Transgenerational Stability of Methylation Alleles following Genomic Shock: Given that introgressive hybridization is a recurring phenomenon in crop plant enhancement, resulting in genomic shock and subsequent methylome remodeling, I will analyze introgression lines derived from crosses between wild and domesticated sunflowers to identify methylation patterns stable across multiple generations.
Objective 3 - Inference of Evolutionary Parameters in Crop Plants with Varied Methylation Patterns: I will analyze publicly accessible datasets containing genomes and methylomes from nine crop plants and their wild relatives to quantify the evolutionary forces affecting plant DNA methylation. This analysis aims to determine the variation in methylation rates across the phylogeny, facilitated by comparisons to the model plant Arabidopsis.
Through the development of a pioneering evolutionary inference approach for methylomes, the identification of the optimal marker class of crop plant methylation analysis, and the analysis of multiple open access crop plant methylomes, mC-EVOLVE is dedicated to advancing our comprehension of the evolutionary dynamics underlying crop plant DNA methylation.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
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Mots‑clés
Programme(s)
- HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA) Main Programme
Appel à propositions
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) HORIZON-MSCA-2023-PF-01
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HORIZON-TMA-MSCA-PF-GF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - Global FellowshipsCoordinateur
80333 Muenchen
Allemagne