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The evolutionary biology of crop plant DNA methylation

Projektbeschreibung

Die Geheimnisse der Epigenomevolution von Nutzpflanzen

Nutzpflanzen sind unverzichtbar für die globale Ernährungssicherheit, doch das Wissen zu ihrer genetischen Vielfalt ist unvollständig. Die DNA-Methylierung, ein zentraler epigenetischer Mechanismus, ist entscheidend für die Reaktion der Pflanze auf Umweltstress und die Evolution im Laufe der Zeit. Unterstützt über die Marie-Skłodowska-Curie-Maßnahmen werden im Projekt mC-EVOLVE die evolutionären Grundsätze der Methylierungsvielfalt bei Nutzpflanzen untersucht. Das mC-EVOLVE-Team integriert mathematische Modellierung, Populationsgenetik und Epigenetik, um die evolutionären und umweltbedingten Einflüsse auf die Methylierung zu verstehen, die Stabilität der Methylierungsmuster über Generationen hinweg zu prüfen und die evolutionären Kräfte bei verschiedenen Nutzpflanzen zu quantifizieren. Mit der Forschung könnten neue Möglichkeiten aufkommen, die Resilienz und Anpassungsfähigkeit von Nutzpflanzen zu stärken, was wichtig für kommende landwirtschaftliche Innovationen ist.

Ziel

In this project, mC-EVOLVE, I aim to decipher the evolutionary principles governing crop plant methylation diversity. This newfound knowledge will unlock investigations into an underexplored source of functional variation. The project employs a multidisciplinary approach that encompasses mathematical modeling, population genetics, and epigenetics. It is structured around three main objectives:

Objective 1 - Separation of Evolutionary and Environmental Forces on Methylomes: I will develop an innovative inference tool to disentangle neutral, selective, and environmental influences on methylation variants. This will be achieved by inferring the genealogy along the methylome and evaluating the local correlations between genetic and methylation variants.

Objective 2 - Assessment of Transgenerational Stability of Methylation Alleles following Genomic Shock: Given that introgressive hybridization is a recurring phenomenon in crop plant enhancement, resulting in genomic shock and subsequent methylome remodeling, I will analyze introgression lines derived from crosses between wild and domesticated sunflowers to identify methylation patterns stable across multiple generations.

Objective 3 - Inference of Evolutionary Parameters in Crop Plants with Varied Methylation Patterns: I will analyze publicly accessible datasets containing genomes and methylomes from nine crop plants and their wild relatives to quantify the evolutionary forces affecting plant DNA methylation. This analysis aims to determine the variation in methylation rates across the phylogeny, facilitated by comparisons to the model plant Arabidopsis.

Through the development of a pioneering evolutionary inference approach for methylomes, the identification of the optimal marker class of crop plant methylation analysis, and the analysis of multiple open access crop plant methylomes, mC-EVOLVE is dedicated to advancing our comprehension of the evolutionary dynamics underlying crop plant DNA methylation.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.

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Schlüsselbegriffe

Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).

Programm/Programme

Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.

Thema/Themen

Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.

Finanzierungsplan

Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.

HORIZON-TMA-MSCA-PF-GF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - Global Fellowships

Alle im Rahmen dieses Finanzierungsinstruments finanzierten Projekte anzeigen

Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.

(öffnet in neuem Fenster) HORIZON-MSCA-2023-PF-01

Alle im Rahmen dieser Aufforderung zur Einreichung von Vorschlägen finanzierten Projekte anzeigen

Koordinator

TECHNISCHE UNIVERSITAET MUENCHEN
Netto-EU-Beitrag

Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.

€ 280 751,52
Adresse
Arcisstrasse 21
80333 Muenchen
Deutschland

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Region
Bayern Oberbayern München, Kreisfreie Stadt
Aktivitätstyp
Higher or Secondary Education Establishments
Links
Gesamtkosten

Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.

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