Opis projektu
Poznawanie tajemnic ewolucji epigenomu roślin uprawnych
Rośliny uprawne są kluczem do zapewnienia bezpieczeństwa żywnościowego na świecie. Mimo tego wiedza na temat różnorodności genetycznej pozostaje niekompletna. Metylacja DNA, kluczowy mechanizm w epigenetyce, odgrywa istotną rolę w procesie odpowiedzi roślin na stres środowiskowy i ich rozwój w czasie. Zespół finansowanego ze środków działania „Maria Skłodowska-Curie” projektu mC-EVOLVE ma na celu poznanie ewolucyjnych zasad rządzących różnorodnością metylacji roślin uprawnych. Dzięki użyciu modelowania matematycznego, metod z zakresu genetyki populacyjnej i epigenetyki, badacze rozdzielą wpływ czynników ewolucyjnych i środowiskowych na metylację, przeprowadzą ocenę stabilności modeli metylacji w różnych pokoleniach oraz ilościowo określą wpływ czynników ewolucyjnych na różne rośliny uprawne. Rezultatem tych badań będzie odblokowanie nowych sposobów na zwiększenie odporności i zdolności adaptacyjnych roślin uprawnych, co jest istotne z punktu widzenia przyszłych innowacji w rolnictwie.
Cel
In this project, mC-EVOLVE, I aim to decipher the evolutionary principles governing crop plant methylation diversity. This newfound knowledge will unlock investigations into an underexplored source of functional variation. The project employs a multidisciplinary approach that encompasses mathematical modeling, population genetics, and epigenetics. It is structured around three main objectives:
Objective 1 - Separation of Evolutionary and Environmental Forces on Methylomes: I will develop an innovative inference tool to disentangle neutral, selective, and environmental influences on methylation variants. This will be achieved by inferring the genealogy along the methylome and evaluating the local correlations between genetic and methylation variants.
Objective 2 - Assessment of Transgenerational Stability of Methylation Alleles following Genomic Shock: Given that introgressive hybridization is a recurring phenomenon in crop plant enhancement, resulting in genomic shock and subsequent methylome remodeling, I will analyze introgression lines derived from crosses between wild and domesticated sunflowers to identify methylation patterns stable across multiple generations.
Objective 3 - Inference of Evolutionary Parameters in Crop Plants with Varied Methylation Patterns: I will analyze publicly accessible datasets containing genomes and methylomes from nine crop plants and their wild relatives to quantify the evolutionary forces affecting plant DNA methylation. This analysis aims to determine the variation in methylation rates across the phylogeny, facilitated by comparisons to the model plant Arabidopsis.
Through the development of a pioneering evolutionary inference approach for methylomes, the identification of the optimal marker class of crop plant methylation analysis, and the analysis of multiple open access crop plant methylomes, mC-EVOLVE is dedicated to advancing our comprehension of the evolutionary dynamics underlying crop plant DNA methylation.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego.
- nauki przyrodniczenauki biologicznemorfologia biologicznamorfologia porównawcza
- nauki przyrodniczenauki biologicznegenetykaDNA
- nauki rolniczerolnictwo, leśnictwo i rybołówstworolnictwoziarna i nasiona oleistenasiona oleiste
- nauki przyrodniczenauki biologicznegenetykagenom
- nauki przyrodniczenauki biologicznegenetykaepigenetyka
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Słowa kluczowe
Program(-y)
- HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA) Main Programme
Zaproszenie do składania wniosków
Zobacz inne projekty w ramach tego zaproszeniaSystem finansowania
HORIZON-TMA-MSCA-PF-GF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - Global FellowshipsKoordynator
80333 Muenchen
Niemcy