Description du projet
Démêler les voies de réplication et de libération des entérovirus
Les entérovirus sont à l’origine de nombreuses maladies, du rhume à la myocardite en passant par la poliomyélite. Pour ce faire, ils modifient le cytoplasme des cellules hôtes afin de créer des organites permettant une réplication efficace du génome viral et utilisent la voie de l’autophagie sécrétoire de la cellule pour la réplication et la libération du virus. Des travaux récents ont mis en évidence certaines structures impliquées dans ce processus, notamment l’activité 2C ATPase, un lien potentiel associé à la membrane d’un organite de réplication et des protéines filamentaires portées par certains autophagosomes. Avec le soutien du programme Actions Marie Skłodowska-Curie, le projet EnteroInfection vise à étudier le rôle des protéines 2C et filamentaires dans la réplication des entérovirus, en se concentrant sur les virus responsables de la myocardite et de la poliomyélite.
Objectif
Enteroviruses (EVs) are positive-sense, single stranded RNA virus from the Picornaviridae family. With 106 types, they can cause mild to severe diseases in human, especially children, such as common cold (Rhinovirus), myocarditis (Coxsackievirus B3, CVB3) or poliomyelitis (Poliovirus, PV). EVs are known to remodel the cytoplasm of host cells to create replication organelles allowing efficient viral genome replication. They also hijack the secretory autophagy pathway for replication and viral release. Recent cryo-electron tomography (cryo-ET) work done in the Carlson lab has highlight that PV virions directly assemble on replication membrane through a tethering complex where the tether is thought to be viral ATPase 2C. Moreover, they were able to show one class of autophagosomes is carrying bundles of filament proteins, suspected as filamentous actin (F-actin). My project will address two questions in EV replication: (i) how does the viral protein 2C assist membrane-localized assembly? (ii) what is the identity and role of the filaments in virus-induced autophagy? I will use an integrative approach of cell biology, biochemistry and structural biology and PV and CVB3 will be used as model viruses for this project. I first aim to characterize the viral assembly complex by in vitro reconstitution of the interaction between model membranes, purified 2C, capsid proteins and RNA through cross-linking mass spectrometry (XL-MS) and cryo-ET. By combining focus-ion-beam (FIB) milling and cryo-ET to perform subtomogram averaging, I will study the structure of the tethering complex and the one of the filament proteins found in autophagosomes of infected cells. In parallel, to aid the identification of the filament, I will perform proteomic studies through MS study on isolated autophagosomes infected cells. Finally, combined with knock-out cells, I will be able to identify potential protein candidates and test their effect on EV infection through cryo-ET and live cell imaging.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines
- sciences naturelles sciences biologiques génétique génome génome viral
- sciences naturelles sciences physiques optique microscopie electron microscopy
- sciences naturelles sciences biologiques biologie moléculaire biologie structurale
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) HORIZON-MSCA-2023-PF-01
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
901 87 UMEA
Suède
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.