Descripción del proyecto
Mutaciones ocultas en enfermedades genómicas raras
Más de doscientos millones de personas en todo el mundo padecen enfermedades genómicas raras (RGD, por sus siglas en inglés), pero menos de la mitad reciben un diagnóstico molecular. De este modo, millones de personas se ven abocadas a prolongadas odiseas diagnósticas, lo que limita las oportunidades de atención personalizada. Las nuevas investigaciones destacan el papel de las mutaciones complejas del ADN, en concreto las variaciones estructurales (SV, por sus siglas en inglés) y las repeticiones cortas en tándem (STR, por sus siglas en inglés), en muchas RGD no diagnosticadas. Estos cambios genéticos, que abarcan múltiples pares de bases, siguen siendo poco conocidos. El equipo del proyecto DETECT-SV-RD, financiado por las Acciones Marie Skłodowska-Curie, aborda este reto analizando más de 1 400 genomas mediante tecnologías punteras de secuenciación y cartografía óptica del genoma. En general, en el proyecto se pretende descubrir SV y STR, incluso en regiones genómicas complejas, e integrar los hallazgos con datos clínicos para mejorar las tasas de diagnóstico.
Objetivo
Rare Genomic Diseases (RGDs) affect >200 million individuals globally, however less than half of patients receive a molecular diagnosis, forcing millions into year-long diagnostic odysseys, and limiting the possibilities for personalized care. New studies suggest that forms of DNA mutation affecting many base pairs of at once, so-called 'Structural Variations' (SVs) and 'Short Tandem Repeats' (STRs) may play a dominant role in the biological underpinnings of many undiagnosed RGDs.
The DETECT-SV-RD project will utilise one of the largest-to-date RD-patient datasets, containing >1,400 genomes obtained by latest long-read sequencing and optical genome mapping technologies, to identify the full spectrum of SVs and better understand their impact on disease formation. To achieve this, a new computational workflow for detecting SVs will be developed, which will have a special focus on mutations that occur in the most complex, repeat-rich regions of the human genome. Using these technological advances, SVs and STRs will be identified across all patients, and carefully characterized in terms of their rarity, the properties of their breakpoints and likely biological formation mechanisms. Lastly, these insights will be combined with orthogonal 'omics' and phenotypic data to gain new insights into the underlying biology of rare diseases. In collaboration with the diagnostic department at Radboudumc, new genetic tests for SVs and STRs will finally be implemented to improve patient care.
The project will, for the first time, assess the effect of SVs and STRs even in complex genomic regions comprehensively and provide an estimate for their involvement in the formation of RDs in general, as well as likely a better understanding of previously undiagnosed RDs. The project will thus contribute to improving the rate of correct RD diagnoses in the future, providing substantial emotional and physical relief to affected patients and their families.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural.
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural.
- ciencias naturalesciencias biológicasgenéticaADN
- ciencias naturalesciencias biológicasgenéticamutación
- ciencias naturalesciencias biológicasgenéticagenoma
Para utilizar esta función, debe iniciar sesión o registrarse
Palabras clave
Programa(s)
- HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA) Main Programme
Régimen de financiación
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European FellowshipsCoordinador
6525 GA Nijmegen
Países Bajos