Projektbeschreibung
Versteckte Mutationen bei seltenen genomischen Erkrankungen
Weltweit leiden mehr als 200 Millionen Menschen an seltenen genomischen Erkrankungen, doch weniger als die Hälfte erhält eine molekulare Diagnose. Dies führt dazu, dass sich Millionen Menschen auf eine langwierige diagnostische Odyssee begeben müssen, wodurch die Möglichkeiten für eine personalisierte Versorgung eingeschränkt werden. Neue Forschungsergebnisse unterstreichen die Rolle komplexer DNS-Mutationen, insbesondere struktureller Variationen und kurzer Tandemwiederholungen, bei vielen nicht diagnostizierten seltenen genomischen Erkrankungen. Diese genetischen Veränderungen, die sich über mehrere Basenpaare erstrecken, sind nach wie vor größtenteils unerforscht. Im Rahmen des über die Marie-Skłodowska-Curie-Maßnahmen unterstützten Projekts DETECT-SV-RD wird sich dieser Herausforderung gestellt, indem über 1 400 Genome mithilfe modernster Sequenzierung und optischer Genomkartierung analysiert werden. Das übergeordnete Projektziel lautet, strukturelle Variationen und kurze Tandemwiederholungen selbst in komplexen genomischen Regionen zu entdecken und die Ergebnisse mit klinischen Daten zu verknüpfen, um die Diagnoseraten zu verbessern.
Ziel
Rare Genomic Diseases (RGDs) affect >200 million individuals globally, however less than half of patients receive a molecular diagnosis, forcing millions into year-long diagnostic odysseys, and limiting the possibilities for personalized care. New studies suggest that forms of DNA mutation affecting many base pairs of at once, so-called 'Structural Variations' (SVs) and 'Short Tandem Repeats' (STRs) may play a dominant role in the biological underpinnings of many undiagnosed RGDs.
The DETECT-SV-RD project will utilise one of the largest-to-date RD-patient datasets, containing >1,400 genomes obtained by latest long-read sequencing and optical genome mapping technologies, to identify the full spectrum of SVs and better understand their impact on disease formation. To achieve this, a new computational workflow for detecting SVs will be developed, which will have a special focus on mutations that occur in the most complex, repeat-rich regions of the human genome. Using these technological advances, SVs and STRs will be identified across all patients, and carefully characterized in terms of their rarity, the properties of their breakpoints and likely biological formation mechanisms. Lastly, these insights will be combined with orthogonal 'omics' and phenotypic data to gain new insights into the underlying biology of rare diseases. In collaboration with the diagnostic department at Radboudumc, new genetic tests for SVs and STRs will finally be implemented to improve patient care.
The project will, for the first time, assess the effect of SVs and STRs even in complex genomic regions comprehensively and provide an estimate for their involvement in the formation of RDs in general, as well as likely a better understanding of previously undiagnosed RDs. The project will thus contribute to improving the rate of correct RD diagnoses in the future, providing substantial emotional and physical relief to affected patients and their families.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
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- NaturwissenschaftenBiowissenschaftenGenetikDNS
- NaturwissenschaftenBiowissenschaftenGenetikMutation
- NaturwissenschaftenBiowissenschaftenGenetikGenom
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Schlüsselbegriffe
Programm/Programme
- HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA) Main Programme
Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
(öffnet in neuem Fenster) HORIZON-MSCA-2023-PF-01
Andere Projekte für diesen Aufruf anzeigenFinanzierungsplan
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European FellowshipsKoordinator
6525 GA Nijmegen
Niederlande