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Spatiotemporal dynamics of secondary metabolism in the ocean microbiome

Ziel

Microbial secondary metabolism (SM) is critical to ecological interactions because it is a source of bioactive products such as antibiotics and anti-cancer drugs. Marine microbes are prolific sources of these compounds. Until now, the prospection of biosynthetic gene clusters has primarily focused on cataloguing SM diversity by using machine learning (ML) tools, with little regard to their importance for the microbial dynamics. Microbes benefit from SM by providing a chemical language for inter-specific communication and improving environmental interaction. The dynamics and evolutionary aspects of this interaction, as well as its effects on spatiotemporal microbial dynamics, have not been studied due to a lack of suitable datasets. To elucidate this, the SPADYN-SM project aims to investigate the spatiotemporal dynamics of SM in the ocean microbiome using an innovative genome-resolved work frame to verify diversity, mutations, selection pressures, and effects on environmental variables in a collection of metagenomes from monthly marine samples collected by the host and collaborators over a 7-years period. Dr. Santos will combine his unique expertise in biochemistry, molecular biology, bioinformatics, and ML with the host's notorious experience in microbial ecology and evolution to document the fluctuation of SM in marine microbes for the first time on an unprecedented temporal scale. SPADYN-SM could lead to a better understanding of seasonal patterns of SM in marine microbes, environmental effects, and possible impacts on microbial evolution. SPADYN-SM continues to advocate for the analysis of polymorphisms at the protein structure level, which may lead to the discovery of novel drug-like compounds. This highly interdisciplinary project, with its international collaborative network and innovation, will advance the EU's research and policy strategies, such as biotechnology and microbial community modeling fields, and will boost Dr. Santos' promising carreer.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.

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Schlüsselbegriffe

Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).

Programm/Programme

Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.

Thema/Themen

Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.

Finanzierungsplan

Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Alle im Rahmen dieses Finanzierungsinstruments finanzierten Projekte anzeigen

Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.

(öffnet in neuem Fenster) HORIZON-MSCA-2023-PF-01

Alle im Rahmen dieser Aufforderung zur Einreichung von Vorschlägen finanzierten Projekte anzeigen

Koordinator

AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGACIONES CIENTIFICAS
Netto-EU-Beitrag

Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.

€ 165 312,96
Adresse
CALLE SERRANO 117
28006 MADRID
Spanien

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Region
Comunidad de Madrid Comunidad de Madrid Madrid
Aktivitätstyp
Research Organisations
Links
Gesamtkosten

Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.

Keine Daten

Partner (1)

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