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Spatiotemporal dynamics of secondary metabolism in the ocean microbiome

Obiettivo

Microbial secondary metabolism (SM) is critical to ecological interactions because it is a source of bioactive products such as antibiotics and anti-cancer drugs. Marine microbes are prolific sources of these compounds. Until now, the prospection of biosynthetic gene clusters has primarily focused on cataloguing SM diversity by using machine learning (ML) tools, with little regard to their importance for the microbial dynamics. Microbes benefit from SM by providing a chemical language for inter-specific communication and improving environmental interaction. The dynamics and evolutionary aspects of this interaction, as well as its effects on spatiotemporal microbial dynamics, have not been studied due to a lack of suitable datasets. To elucidate this, the SPADYN-SM project aims to investigate the spatiotemporal dynamics of SM in the ocean microbiome using an innovative genome-resolved work frame to verify diversity, mutations, selection pressures, and effects on environmental variables in a collection of metagenomes from monthly marine samples collected by the host and collaborators over a 7-years period. Dr. Santos will combine his unique expertise in biochemistry, molecular biology, bioinformatics, and ML with the host's notorious experience in microbial ecology and evolution to document the fluctuation of SM in marine microbes for the first time on an unprecedented temporal scale. SPADYN-SM could lead to a better understanding of seasonal patterns of SM in marine microbes, environmental effects, and possible impacts on microbial evolution. SPADYN-SM continues to advocate for the analysis of polymorphisms at the protein structure level, which may lead to the discovery of novel drug-like compounds. This highly interdisciplinary project, with its international collaborative network and innovation, will advance the EU's research and policy strategies, such as biotechnology and microbial community modeling fields, and will boost Dr. Santos' promising carreer.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Parole chiave

Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).

Programma(i)

Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo schema di finanziamento

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

(si apre in una nuova finestra) HORIZON-MSCA-2023-PF-01

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito del bando

Coordinatore

AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGACIONES CIENTIFICAS
Contributo netto dell'UE

Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.

€ 165 312,96
Indirizzo
CALLE SERRANO 117
28006 MADRID
Spagna

Mostra sulla mappa

Regione
Comunidad de Madrid Comunidad de Madrid Madrid
Tipo di attività
Research Organisations
Collegamenti
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

Nessun dato

Partner (1)

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