Descrizione del progetto
Comprendere la fisiopatologia del diabete di tipo 2 per le strategie di modifica della malattia
Il diabete di tipo 2 colpisce 1 adulto su 10 in tutto il mondo e causa 1,5 milioni di decessi all’anno. Programmi trascrizionali anomali nelle β-cellule pancreatiche contribuiscono al diabete di tipo 2, ma la nostra comprensione di questo aspetto rimane incompleta. Le attuali terapie farmacologiche agiscono principalmente sull’iperglicemia piuttosto che sulle cause alla base della malattia. Il progetto HuPIPA, finanziato dal programma di azioni Marie Skłodowska-Curie, mira a chiarire le variazioni degli stati trascrizionali delle cellule β. Saranno identificati gli stati cellulari chiave studiando le risposte regolatorie alle perturbazioni, offrendo approfondimenti sulla fisiopatologia del diabete di tipo 2 e contribuendo allo sviluppo di strategie di modifica della malattia. Il progetto amplierà il concetto di Atlante cellulare umano per creare l’Atlante delle perturbazioni delle isole di Langerhans umane, caratterizzando le dinamiche dello stato cellulare attraverso varie perturbazioni.
Obiettivo
Type 2 diabetes (or T2D) is a heterogeneous disease that affects nearly 1 in 10 adults worldwide, directly causing 1.5 million deaths each year. Human genetics and single cell genomic studies show that abnormal pancreatic β-cell transcriptional programs play a crucial role in type 2 diabetes. However, we lack an understanding of how this is translated into impaired β-cell function or mass.
Consequently, existing drug therapies for T2D aim to alleviate hyperglycaemia, but do not target causal mechanisms.
My overarching goal is to understand variation of β-cell transcriptional states.
I postulate that even if an infinite number of perturbations are conceivable, only a finite number of cell states exist. Identifying and characterizing major cellular states, by studying regulatory responses to perturbations could provide insights into T2D pathophysiology, and pave the way for disease-modifying strategies.
The concept of Human Cell Atlas currently depicts the cells landscape under one theoretical average condition, and does not represent the broad range of possible cell states that exist in different conditions. I'll be extending this concept towards the production of a Human Pancreatic Islet Perturbation Atlas (HuPIPA), which has the potential to be the first atlas characterizing cell states dynamics through multiple perturbations. I will harness this resource to unravel T2D mechanisms and to discover candidate therapeutic strategies.
To this end, I will design a large-scale single-cell multiomics experiment of human islets facing chemogenetic perturbations. I will
develop a novel statistical tool for the analysis of single-cell multiomics data under a broad range of conditions, and perform an
integrative analysis with T2D human genetic and single cell datasets.
This project, at the junction of statistics, genetics and computer science, has the potential to provide new knowledge for a better
understanding and treatment of T2D.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
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- scienze mediche e della salutemedicina di basefisiologiafisiopatologia
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Programma(i)
- HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA) Main Programme
Invito a presentare proposte
(si apre in una nuova finestra) HORIZON-MSCA-2023-PF-01
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HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF -Coordinatore
08003 Barcelona
Spagna