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Phylogenomic-driven Drug Discovery from Rhodococcus and Saccharomonospora using 2D and 3D Cell Cultures

Descripción del proyecto

Investigar el arsenal microbiano de la naturaleza para combatir la resistencia a los antibióticos

La resistencia a los antibióticos y la escasez de nuevos descubrimientos farmacológicos suponen una amenaza para la salud mundial, ya que las bacterias patógenas evolucionan más rápido de lo que se pueden desarrollar tratamientos. Abordar este problema acuciante requiere la búsqueda de nuevos compuestos bioactivos. Los métodos tradicionales suelen subestimar posibles fuentes de fármacos nuevos, sobre todo dentro de los géneros microbianos menos conocidos. Ello hace necesario métodos innovadores que ayuden a descubrir tesoros farmacológicos ocultos. En el proyecto PhyloDRS, que cuenta con el apoyo de las acciones Marie Skłodowska-Curie, se emplearán cultivos celulares bidimensionales y tridimensionales para investigar el panorama genómico de géneros de actinobacterias poco estudiados. El equipo del proyecto se propone estimular la producción de metabolitos crípticos con técnicas punteras de secuenciación y cultivo. Además, gracias al empleo de estrategias de química analítica, se identificarán y probarán nuevos compuestos bioactivos, lo que favorecerá el descubrimiento de fármacos de gran valor.

Objetivo

The project titled, 'Phylogenomic-driven Drug Discovery from Rhodococcus and Saccharomonospora using 2D and 3D Cell Cultures' aims to explore the microbial diversity and genomic landscape of two important, yet somewhat neglected, natural product producing actinobacterial genera, Rhodococcus and Saccharomonospora. Symbiotic systems and unique habitats will serve as isolation sources of novel species, and I will employ state-of-the-art sequencing techniques to perform a comprehensive in depth phylogenomic analysis to fully depict their biocatalytic repertoire and by doing so, unravel their unique natural product potential. I will spearhead the establishment of novel 2D and 3D cultivation techniques with ecomimetic properties to mimic natural scenarios and thereby trigger the production of cryptic metabolites. I will employ sophisticated dereplication and chemical analytical strategies to characterize and structurally elucidate novel chemical entities with drug-like scaffolds. Based on these results, I will be able to test all of the identified natural products for their pharmacological properties within the framework of the Helmholtz drug discovery pipeline and collaboration partners. My targeted and interdisciplinary research approach will allow me to gain valuable genomic and evolutionary insights and streamline the discovery of pharmaceutically valuable natural product scaffolds.

Ámbito científico (EuroSciVoc)

CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural.

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Coordinador

HELMHOLTZ-ZENTRUM FUR INFEKTIONSFORSCHUNG GMBH
Aportación neta de la UEn
€ 189 687,36
Dirección
INHOFFENSTRASSE 7
38124 Braunschweig
Alemania

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Región
Niedersachsen Braunschweig Braunschweig, Kreisfreie Stadt
Tipo de actividad
Research Organisations
Enlaces
Coste total
Sin datos