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Phylogenomic-driven Drug Discovery from Rhodococcus and Saccharomonospora using 2D and 3D Cell Cultures

Descrizione del progetto

Esplorare l’arsenale microbico della natura per combattere la resistenza agli antibiotici

La resistenza agli antibiotici e la scarsità di scoperte di nuovi farmaci rappresentano una minaccia per la salute a livello globale, in quanto i patogeni microbici si evolvono in modo più rapido rispetto allo sviluppo dei trattamenti; per rispondere a questa urgente necessità, risulta necessario ricercare nuovi composti bioattivi. I metodi tradizionali spesso trascurano le potenziali fonti di nuovi farmaci, in particolare all’interno di generi microbici meno conosciuti, generando una lacuna che richiede approcci innovativi al fine di scoprire tesori farmacologici nascosti. Il progetto PhyloDRS, sostenuto dal programma di azioni Marie Skłodowska-Curie, sfrutta colture cellulari 2D e 3D allo scopo di studiare il paesaggio genomico di generi di attinobatteri poco esplorati. Avvalendosi di tecniche di sequenziamento e di coltivazione all’avanguardia, il progetto si prefigge di stimolare la produzione di metaboliti criptici. PhyloDRS impiegherà tecniche basate sulla chimica analitica avanzata al fine di identificare e testare nuovi composti bioattivi, migliorando il processo di scoperta di preziosi prodotti farmaceutici.

Obiettivo

The project titled, 'Phylogenomic-driven Drug Discovery from Rhodococcus and Saccharomonospora using 2D and 3D Cell Cultures' aims to explore the microbial diversity and genomic landscape of two important, yet somewhat neglected, natural product producing actinobacterial genera, Rhodococcus and Saccharomonospora. Symbiotic systems and unique habitats will serve as isolation sources of novel species, and I will employ state-of-the-art sequencing techniques to perform a comprehensive in depth phylogenomic analysis to fully depict their biocatalytic repertoire and by doing so, unravel their unique natural product potential. I will spearhead the establishment of novel 2D and 3D cultivation techniques with ecomimetic properties to mimic natural scenarios and thereby trigger the production of cryptic metabolites. I will employ sophisticated dereplication and chemical analytical strategies to characterize and structurally elucidate novel chemical entities with drug-like scaffolds. Based on these results, I will be able to test all of the identified natural products for their pharmacological properties within the framework of the Helmholtz drug discovery pipeline and collaboration partners. My targeted and interdisciplinary research approach will allow me to gain valuable genomic and evolutionary insights and streamline the discovery of pharmaceutically valuable natural product scaffolds.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

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Coordinatore

HELMHOLTZ-ZENTRUM FUR INFEKTIONSFORSCHUNG GMBH
Contribution nette de l'UE
€ 189 687,36
Indirizzo
INHOFFENSTRASSE 7
38124 Braunschweig
Germania

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Regione
Niedersachsen Braunschweig Braunschweig, Kreisfreie Stadt
Tipo di attività
Research Organisations
Collegamenti
Costo totale
Nessun dato