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Advancing Machine-Learned Interatomic Potentials for Proteins Simulation (MLP4ProSim): From Development to Application

Ziel

Atomic simulation of the proteins is one of the main tools in understanding the functions, interactions, and dynamics of these vitally important biomolecules and plays a pivotal role in numerous cutting-edge researches such as elucidating the pathways of diseases, drug discovery and so on. The limited accuracy of the classical force fields specially in approximating non-bonded interactions as well as in capturing kinetics of proteins has attracted attentions towards more advanced alternatives. MLP4ProSim aims to develop next-generation transferable all-atom machine-learned potentials (MLPs) for computer simulation of proteins. To assure the applicability of the developed potentials for more realistic and biologically relevant simulations, training of the MLPs is carried out using a critically assessed dataset containing both quantum-mechanically computed and experimentally determined reference data. Enabling transferability of the developed MLPs and their applicability for the simulation of different proteins without requiring demanding retraining processes will be addressed by considering training sets containing proteins with diverse shapes, functions, and sizes. The resulting MLPs, after being validated for reliability and transferability via extensive benchmark tests, will be implemented in LAMMPS as an extensively applied molecular dynamics simulation code to make it openly accessible to the community. The successful completion of the project objectives is expected to have significant impacts in a broad range of scientific and technological areas. In addition to the anticipated outstanding scientific impacts, this project encompasses comprehensive trainings planned for the experienced researcher Dr. Amin Alibakhshi in accordance with the objectives of the Horizon Europe Framework Programme. This training aims to equip him with the essential skills and innovative capabilities required to emerge as a future leader at the forefront of academic excellence.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.

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Schlüsselbegriffe

Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).

Programm/Programme

Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.

Thema/Themen

Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.

Finanzierungsplan

Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Alle im Rahmen dieses Finanzierungsinstruments finanzierten Projekte anzeigen

Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.

(öffnet in neuem Fenster) HORIZON-MSCA-2023-PF-01

Alle im Rahmen dieser Aufforderung zur Einreichung von Vorschlägen finanzierten Projekte anzeigen

Koordinator

SCUOLA INTERNAZIONALE SUPERIORE DI STUDI AVANZATI DI TRIESTE
Netto-EU-Beitrag

Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.

€ 188 590,08
Adresse
VIA BONOMEA 265
34136 Trieste
Italien

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Region
Nord-Est Friuli-Venezia Giulia Trieste
Aktivitätstyp
Higher or Secondary Education Establishments
Links
Gesamtkosten

Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.

Keine Daten

Partner (1)

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