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Advancing Machine-Learned Interatomic Potentials for Proteins Simulation (MLP4ProSim): From Development to Application

Obiettivo

Atomic simulation of the proteins is one of the main tools in understanding the functions, interactions, and dynamics of these vitally important biomolecules and plays a pivotal role in numerous cutting-edge researches such as elucidating the pathways of diseases, drug discovery and so on. The limited accuracy of the classical force fields specially in approximating non-bonded interactions as well as in capturing kinetics of proteins has attracted attentions towards more advanced alternatives. MLP4ProSim aims to develop next-generation transferable all-atom machine-learned potentials (MLPs) for computer simulation of proteins. To assure the applicability of the developed potentials for more realistic and biologically relevant simulations, training of the MLPs is carried out using a critically assessed dataset containing both quantum-mechanically computed and experimentally determined reference data. Enabling transferability of the developed MLPs and their applicability for the simulation of different proteins without requiring demanding retraining processes will be addressed by considering training sets containing proteins with diverse shapes, functions, and sizes. The resulting MLPs, after being validated for reliability and transferability via extensive benchmark tests, will be implemented in LAMMPS as an extensively applied molecular dynamics simulation code to make it openly accessible to the community. The successful completion of the project objectives is expected to have significant impacts in a broad range of scientific and technological areas. In addition to the anticipated outstanding scientific impacts, this project encompasses comprehensive trainings planned for the experienced researcher Dr. Amin Alibakhshi in accordance with the objectives of the Horizon Europe Framework Programme. This training aims to equip him with the essential skills and innovative capabilities required to emerge as a future leader at the forefront of academic excellence.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Parole chiave

Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).

Programma(i)

Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo schema di finanziamento

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

(si apre in una nuova finestra) HORIZON-MSCA-2023-PF-01

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito del bando

Coordinatore

SCUOLA INTERNAZIONALE SUPERIORE DI STUDI AVANZATI DI TRIESTE
Contributo netto dell'UE

Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.

€ 188 590,08
Indirizzo
VIA BONOMEA 265
34136 Trieste
Italia

Mostra sulla mappa

Regione
Nord-Est Friuli-Venezia Giulia Trieste
Tipo di attività
Higher or Secondary Education Establishments
Collegamenti
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

Nessun dato

Partner (1)

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