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CORDIS - Resultados de investigaciones de la UE
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High throughput development platform for oligonucleotide aptamers

Descripción del proyecto

Un nuevo diseño de sonda con análisis de molécula única

La terapéutica, la microscopía de superresolución y los ensayos bioquímicos dependen de sondas de afinidad para varias aplicaciones, todas las cuales requieren cinéticas de unión específicas que varían en función de la aplicación. Lamentablemente, los métodos de desarrollo actuales no pueden especificar la cinética de unión durante el proceso de diseño. Dicha limitación ha obstaculizado los descubrimientos y ha reducido considerablemente el potencial de estas tecnologías. El proyecto SPARXS, financiado por el Consejo Europeo de Investigación, pretende desarrollar una solución innovadora: el análisis paralelo de moléculas individuales para la exploración rápida del espacio de secuencias (SPARXS). La solución utilizará observaciones de molécula única y secuenciación de alto rendimiento para proporcionar datos cruciales que permitan el diseño a medida de sondas con cinética de unión optimizada.

Objetivo

The binding kinetics of an affinity probethe speed and duration with which it attaches to a target moleculemust be precisely tuned for numerous applications in therapeutics, super-resolution microscopy, and biochemical assays. The current methods of development lack the capability to specify these binding kinetics during probe design, resulting in the potential for effective drugs and relevant biological properties to remain undiscovered.

Here, I introduce a game-changing solution: Single-molecule Parallel Analysis for Rapid eXploration of Sequence space (SPARXS). SPARXS harnesses the power of single-molecule observations and subsequent high-throughput sequencing to simultaneously reveal the binding kinetics and sequences of millions of aptamers (affinity probes composed of nucleic acids). This process enables the tailored design of probes with the desired binding behavior for various applications.

This technology originated from my ERC Consolidator Grant project as a research tool, and its application can fulfill multiple practical demands. As SPARXS provides a particularly excellent fit for aptamer development, I have decided to enhance the platform with aptamer-specific features. Furthermore, I will conduct market research to understand the specific demands of users seeking defined-kinetic probes, which will facilitate commercialization of SPARXS-based aptamer design upon completion of the project.

In summary, SPARXS signifies a disruptive advancement in aptamer development and will revolutionize affinity probe design across the biotech industry. With minimal adaptations to the core technology, I anticipate a high potential for swift commercialization as a dedicated development platform.

Ámbito científico (EuroSciVoc)

Palabras clave

Programa(s)

Tema(s)

Régimen de financiación

HORIZON-ERC-POC - HORIZON ERC Proof of Concept Grants

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Convocatoria de propuestas

(se abrirá en una nueva ventana) ERC-2023-POC

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Institución de acogida

TECHNISCHE UNIVERSITEIT DELFT
Aportación neta de la UEn
€ 150 000,00
Coste total
Sin datos

Beneficiarios (1)