Descripción del proyecto
Nuevos conocimientos sobre la replicación de los nidovirus
Los nidovirus son un grupo heterogéneo de virus de ARN que incluyen coronavirus bien conocidos como el coronavirus del síndrome respiratorio agudo grave de tipo 2, así como a la familia de virus Arteriviridae, menos estudiados pero comunes en poblaciones animales. El proyecto NidoRep, financiado por el Consejo Europeo de Investigación, tiene por objeto colmar esta brecha del conocimiento centrándose en cómo se replican los virus de la familia Arteriviridae, ofreciendo así la primera visión detallada de su maquinaria de replicación única. En este estudio se examinará cómo difieren la velocidad y la precisión de replicación entre los nidovirus, lo cual proporcionará datos básicos sobre su diversidad evolutiva. Mediante el estudio de estos mecanismos, el equipo de NidoRep se propone aportar información para desarrollar fármacos contra estos virus diversos y, en último término, mejorar la preparación para futuros brotes víricos con potencial epidémico.
Objetivo
Nidoviruses are an intriguing group of +RNA viruses, whose diverse genome sizes (11-41 kb) reflect a long history of adaptation to suit specific niches. They remain mostly neglected, with the exception of the large-genome Coronaviridae (CoV) family (32 kb), which includes the notorious human pathogen SARS-CoV-2. At the other end of the size-spectrum is the small-genome Arteriviridae (ArV) family (11 kb), an understudied group of prevalent, animal-infecting pathogens. Viral replication is mediated by a suite of enzymes known as the replication transcription complex (RTC), at the core of which is the RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) and its unique Nterminal domain, known as the NiRAN. NidoRep aims to bridge the prevalent knowledge-gap between small and large genome nidoviruses, by deciphering the specific structural and mechanistic features of the RTC that regulate genome replication across such vastly different viruses. It will be divided into three distinct objectives: Objective 1 will focus on small-genome nidoviruses, providing the first structural and functional characterization of an ArV RTC. Objective 2 will probe how RdRp speed and fidelity have been fine-tuned to accommodate the distinct and conflicting replication requirements of diverse nidoviruses. This will be achieved through the development of an innovative in vitro sequencing assay, also providing a new and robust tool for screening drugs that corrupt RNA synthesis. Objective 3 will investigate the role of the NiRAN in initiation of RNA synthesis though protein-priming, providing new insight into the functional evolution of this complex domain, while also identifying novel drug-targeting sites. NidoRep will determine how specific viral enzymes have structurally and functionally evolved to support remarkable genome diversification within a single viral order. It will expand our understanding of understudied viruses with epidemic potential, and guide drug design strategies against key viral targets.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural.
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Palabras clave
Programa(s)
- HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC) Main Programme
Régimen de financiación
HORIZON-ERC - HORIZON ERC GrantsInstitución de acogida
75794 Paris
Francia