Descrizione del progetto
Approfondimento sulla replicazione dei nidovirus
I nidovirus sono un gruppo diversificato di virus a RNA che comprende coronavirus ben noti come il SARS-CoV-2, nonché i virus meno studiati Arteriviridae, comuni nelle popolazioni animali. Il progetto NidoRep, finanziato dal CER, cerca di colmare questa lacuna di conoscenze concentrandosi sulle modalità di replicazione dei virus Arteriviridae, offrendo il primo sguardo dettagliato al loro esclusivo meccanismo di replicazione. Questo studio esaminerà come la velocità e l’accuratezza della replicazione differiscano tra i vari nidovirus, fornendo così indicazioni cruciali sulla loro diversità evolutiva. Grazie alla comprensione di questi meccanismi, NidoRep si propone di informare lo sviluppo di farmaci antivirali mirati a questi virus diversi, migliorando in ultima analisi la preparazione per futuri focolai virali con potenziale epidemico.
Obiettivo
Nidoviruses are an intriguing group of +RNA viruses, whose diverse genome sizes (11-41 kb) reflect a long history of adaptation to suit specific niches. They remain mostly neglected, with the exception of the large-genome Coronaviridae (CoV) family (32 kb), which includes the notorious human pathogen SARS-CoV-2. At the other end of the size-spectrum is the small-genome Arteriviridae (ArV) family (11 kb), an understudied group of prevalent, animal-infecting pathogens. Viral replication is mediated by a suite of enzymes known as the replication transcription complex (RTC), at the core of which is the RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) and its unique Nterminal domain, known as the NiRAN. NidoRep aims to bridge the prevalent knowledge-gap between small and large genome nidoviruses, by deciphering the specific structural and mechanistic features of the RTC that regulate genome replication across such vastly different viruses. It will be divided into three distinct objectives: Objective 1 will focus on small-genome nidoviruses, providing the first structural and functional characterization of an ArV RTC. Objective 2 will probe how RdRp speed and fidelity have been fine-tuned to accommodate the distinct and conflicting replication requirements of diverse nidoviruses. This will be achieved through the development of an innovative in vitro sequencing assay, also providing a new and robust tool for screening drugs that corrupt RNA synthesis. Objective 3 will investigate the role of the NiRAN in initiation of RNA synthesis though protein-priming, providing new insight into the functional evolution of this complex domain, while also identifying novel drug-targeting sites. NidoRep will determine how specific viral enzymes have structurally and functionally evolved to support remarkable genome diversification within a single viral order. It will expand our understanding of understudied viruses with epidemic potential, and guide drug design strategies against key viral targets.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP.
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Parole chiave
Programma(i)
- HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC) Main Programme
Argomento(i)
Meccanismo di finanziamento
HORIZON-ERC - HORIZON ERC GrantsIstituzione ospitante
75794 Paris
Francia