Descripción del proyecto
Liberar el potencial de los fagos gigantes en la investigación enzimática traslacional
Los fagos gigantes son virus procariotas (bacterias) con genomas de más de doscientos kilo pares de bases (kb), mientras que los fagos pequeños poseen unos cincuenta kb. Aunque la investigación sobre estos últimos ha contribuido enormemente a la biociencia traslacional en los últimos decenios, muchos genes de fagos gigantes siguen sin caracterizarse. En particular, son portadores de genes que afectan a la maquinaria transcripcional y traduccional de sus hospedadores. Además, algunos productos génicos pueden modificar o degradar los ácidos nucleicos. Suponiendo que los genes aún no caracterizados se comporten de forma similar, podrían beneficiar a la investigación enzimática traslacional. El equipo del proyecto JUPITER, financiado por el Consejo Europeo de Investigación, pretende anotar experimentalmente productos génicos de función desconocida basándose en su capacidad para catalizar las reacciones mencionadas. También aislará y caracterizará especímenes conocidos y nuevos para ampliar los conocimientos existentes sobre la biología de los fagos gigantes.
Objetivo
Jumbo phages are large viruses of prokaryotes with 200 to 800 kilo base-pair (kb) genomes, well beyond the size of small phages that average around 50 kb. While investigation of small phages over the last century has transformed fundamental and translational biosciences, jumbo phages research is only in its infancy. The majority of jumbo phage genes are uncharacterized and cannot be annotated by comparative genomics. Thus, it is unknown how the genes function in jumbo phage biology. Importantly, jumbo phages generally carry genes to take over their hosts transcriptional and translational machinery, in addition to harboring factors that may modify and degrade nucleic acids. Many of the unannotated genes might have similar characteristics, which could be exploited for translational enzyme research. However, those genes remain experimentally under-explored.
The JUPITER project tests the hypothesis that some of the uncharacterized genes have properties that affect their hosts transcriptional and translational machinery, and that some of the gene products could modify or degrade nucleic acids. Using an innovative high-throughput in vitro characterization strategy, I will experimentally annotate gene products of unknown function according to their ability to catalyze the above-mentioned reactions. Known and novel jumbo phages will be isolated and characterized to expand our current knowledge of jumbo phage biology. Promising candidate factors will be characterized in vitro and in vivo to understand their function and to facilitate translational enzyme research.
My results will provide (i) an innovative method for experimental gene annotation, unraveling new mechanisms in jumbo phage biology, (ii) an expansion of the available jumbo phage diversity and (iii) detailed insights into the function of novel factors, unlocking future translational applications in biotechnology.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas genética
- ciencias naturales ciencias biológicas microbiología virología
- ciencias naturales ciencias biológicas bioquímica biomoléculas proteínas enzima
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Palabras clave
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMA PRINCIPAL
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
(se abrirá en una nueva ventana) ERC-2024-STG
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
01513 Vilnius
Lituania
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.