Description du projet
Exploiter le potentiel des phages jumbo dans la recherche translationnelle sur les enzymes
Les phages jumbo sont des virus procaryotes (bactéries) dont le génome est supérieur à 200 kilo-paires de bases (kpb), alors que les petits phages possèdent environ 50 kpb. Bien que la recherche sur ces derniers ait grandement contribué à la bioscience translationnelle au cours des dernières décennies, de nombreux gènes de phages jumbo ne sont toujours pas caractérisés. Ils sont connus pour porter des gènes qui affectent la machinerie transcriptionnelle et traductionnelle de leurs hôtes. De plus, certains produits génétiques peuvent modifier ou dégrader des acides nucléiques. En supposant que les gènes non encore caractérisés se comportent de manière similaire, ils pourraient s’avérer utiles à la recherche translationnelle sur les enzymes. Le projet JUPITER, financé par le CER, entend annoter expérimentalement des produits génétiques de fonction inconnue sur la base de leur capacité à catalyser les réactions décrites plus haut. Il isolera et caractérisera également des spécimens connus et émergents afin d’étendre les connaissances actuelles relatives à la biologie des phages jumbo.
Objectif
Jumbo phages are large viruses of prokaryotes with 200 to 800 kilo base-pair (kb) genomes, well beyond the size of small phages that average around 50 kb. While investigation of small phages over the last century has transformed fundamental and translational biosciences, jumbo phages research is only in its infancy. The majority of jumbo phage genes are uncharacterized and cannot be annotated by comparative genomics. Thus, it is unknown how the genes function in jumbo phage biology. Importantly, jumbo phages generally carry genes to take over their hosts transcriptional and translational machinery, in addition to harboring factors that may modify and degrade nucleic acids. Many of the unannotated genes might have similar characteristics, which could be exploited for translational enzyme research. However, those genes remain experimentally under-explored.
The JUPITER project tests the hypothesis that some of the uncharacterized genes have properties that affect their hosts transcriptional and translational machinery, and that some of the gene products could modify or degrade nucleic acids. Using an innovative high-throughput in vitro characterization strategy, I will experimentally annotate gene products of unknown function according to their ability to catalyze the above-mentioned reactions. Known and novel jumbo phages will be isolated and characterized to expand our current knowledge of jumbo phage biology. Promising candidate factors will be characterized in vitro and in vivo to understand their function and to facilitate translational enzyme research.
My results will provide (i) an innovative method for experimental gene annotation, unraveling new mechanisms in jumbo phage biology, (ii) an expansion of the available jumbo phage diversity and (iii) detailed insights into the function of novel factors, unlocking future translational applications in biotechnology.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques génétique
- sciences naturelles sciences biologiques microbiologie virologie
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines enzyme
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
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(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2024-STG
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
01513 Vilnius
Lituanie
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.