Descripción del proyecto
Identificación de los factores clave de los mecanismos epigenéticos
Todas las células de un organismo contienen la misma información genética, pero la utilizan de forma diferente en función de su contexto. Los mecanismos epigenéticos, en particular las modificaciones postraduccionales de histonas (MPTH) intervienen en la regulación de las interacciones entre los factores de transcripción y el ADN, y cambian durante la diferenciación celular. Aunque se conocen las proteínas responsables de afectar a las MPTH, aún no se sabe cómo se reclutan a sitios genómicos específicos. En el proyecto scEpiTarget, financiado por el Consejo Europeo de Investigación, se desarrollarán métodos de célula única avanzados para identificar los factores clave que influyen en el depósito de MPTH específicas para cada tipo celular. El equipo del proyecto examinará cómo pueden reorientarse las MPTH y evaluará sus efectos sobre las decisiones del destino celular con sistemas de diferenciación celular punteros. Se empleará una nueva técnica para medir las modificaciones de histonas y el ARN total en células individuales, que se combinará con el cribado genético y la biología de la cromatina a fin de obtener una comprensión global del proceso.
Objetivo
Although all cells of an organism share the same genetic information, they selectively access this information in a cell type- and context-dependent manner. Epigenetic mechanisms, such as post-translational histone modifications (PTHMs) have been identified as central regulators of Transcription Factor-DNA interactions. During cell differentiation, the distribution of PTHMs is modulated to enable the new cell state. Most of the protein complexes that position (writer) and remove (eraser) PTHMs have been identified, but we still do not understand how these proteins are recruited to the genome and thereby dictate the specific genomic distribution of PTHMs. Previous studies were unable to identify these targeting factors as they only interact with a fraction of writer complexes at a time and likely form transient interactions. Thus, new experimental approaches are needed to identify these proteins that are directing localised epigenetic changes.
In scEpiTarget I will develop novel single-cell methods to identify the key factors that determine cell-type specific PTHM deposition. I will use the identified regulators to re-target PTHMs and evaluate their impact on cell fate decisions in state-of-the-art cell differentiation systems.
Recently, I made a technological breakthrough by developing a method that allows the simultaneous measurement of histone modifications and total RNA in single cells. Together with my background in genetic screening and chromatin biology, this will enable me to reach scEpiTargets objectives. The proposed techniques are transferable to study any protein:DNA interaction, making them highly valuable for the research community.
Epigenetic pathways are essential for multi-cellular life from the beginning of embryonic development, until their mis-regulation during ageing. The identification of factors regulating PTHM distribution will lead to a better understanding of their function and how they can be therapeutically influenced during pathogenes
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas genética ADN
- ciencias naturales ciencias biológicas bioquímica biomoléculas proteínas
- ciencias naturales ciencias biológicas genética ARN
- ciencias naturales ciencias biológicas genética genoma
- ciencias naturales ciencias biológicas genética epigenética
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Palabras clave
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMA PRINCIPAL
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
(se abrirá en una nueva ventana) ERC-2024-STG
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
8000 Aarhus C
Dinamarca
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.