Description du projet
Identifier les facteurs essentiels des mécanismes épigénétiques
Les cellules d’un organisme contiennent la même information génétique, mais l’utilisent différemment selon le contexte. Les mécanismes épigénétiques, en particulier les modifications post-traductionnelles des histones (PTHM), agissent sur la régulation des interactions entre les facteurs de transcription et l’ADN, et ces modifications changent au cours de la différenciation cellulaire. Si les protéines responsables de la modification des PTHM sont connues, leur mode de recrutement sur des sites génomiques spécifiques n’est pas claire. Le projet scEpiTarget, financé par le CER, entend développer des méthodes avancées pour les cellules uniques afin d’identifier les facteurs essentiels qui influencent le dépôt de PTHM spécifique au type de cellule. Le projet étudiera la manière dont les PTHM peuvent être reciblées et évaluera leurs effets sur les décisions relatives au destin des cellules à l’aide de systèmes de différenciation cellulaire de pointe. Il fera appel à une nouvelle technique pour mesurer les modifications des histones et l’ARN total dans les cellules individuelles, en intégrant le dépistage génétique et les connaissances en biologie de la chromatine pour une compréhension globale du processus.
Objectif
Although all cells of an organism share the same genetic information, they selectively access this information in a cell type- and context-dependent manner. Epigenetic mechanisms, such as post-translational histone modifications (PTHMs) have been identified as central regulators of Transcription Factor-DNA interactions. During cell differentiation, the distribution of PTHMs is modulated to enable the new cell state. Most of the protein complexes that position (writer) and remove (eraser) PTHMs have been identified, but we still do not understand how these proteins are recruited to the genome and thereby dictate the specific genomic distribution of PTHMs. Previous studies were unable to identify these targeting factors as they only interact with a fraction of writer complexes at a time and likely form transient interactions. Thus, new experimental approaches are needed to identify these proteins that are directing localised epigenetic changes.
In scEpiTarget I will develop novel single-cell methods to identify the key factors that determine cell-type specific PTHM deposition. I will use the identified regulators to re-target PTHMs and evaluate their impact on cell fate decisions in state-of-the-art cell differentiation systems.
Recently, I made a technological breakthrough by developing a method that allows the simultaneous measurement of histone modifications and total RNA in single cells. Together with my background in genetic screening and chromatin biology, this will enable me to reach scEpiTargets objectives. The proposed techniques are transferable to study any protein:DNA interaction, making them highly valuable for the research community.
Epigenetic pathways are essential for multi-cellular life from the beginning of embryonic development, until their mis-regulation during ageing. The identification of factors regulating PTHM distribution will lead to a better understanding of their function and how they can be therapeutically influenced during pathogenes
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques génétique ADN
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ARN
- sciences naturelles sciences biologiques génétique génome
- sciences naturelles sciences biologiques génétique épigénétique
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
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(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2024-STG
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
8000 Aarhus C
Danemark
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.