Description du projet
Cartographier la fonction des microprotéines dans les réponses immunitaires
De courts cadres ouverts de lecture dans le génome génèrent des microprotéines qui sont généralement composées de moins de 100 acides aminés. Le rôle émergent de ces molécules remet en question les conceptions traditionnelles de l’annotation des gènes et révèle une diversité cachée de protéomes fonctionnels. Le projet MicroIMMUNE, financé par le CER, vise à cartographier et à étudier les microprotéines dans les cellules immunitaires innées. Grâce à une approche pluridisciplinaire, l’équipe de recherche identifiera les microprotéines dans différentes conditions et examinera leurs rôles fonctionnels. L’étude devrait permettre d’élucider l’impact des microprotéines sur les réponses immunitaires, ouvrant ainsi la voie à l’identification de nouvelles cibles thérapeutiques telles que les peptides antimicrobiens et les médicaments immunomodulateurs.
Objectif
Genome annotation, transcriptomic and proteomic pipelines have traditionally dismissed proteins encoded by short open reading frames (sORF) known as microproteins. This provides a pool of unexplored functional genes. Despite the increasing body of work in identifying the microproteome in different model organisms and cell lines, only a few have been functionally studied showing diverse regulatory roles in multiple cellular pathways.
In MicroIMMUNE, I present a 3-aim workflow combining computational and synthetic biology, protein and genetic engineering approaches designed to systematically uncover the microproteome atlas and investigate its interactome and functional role in innate immune cells.
We aim to:
1) Identify microproteins expressed in innate immune cells under resting and stimulating conditions, using state-of-the-art computational and experimental approaches to study the microproteome.
2) Develop genetic code expansion technologies in innate immune cells to incorporate non-canonical amino acids to study the localization and binding partners of microproteins.
3) Elucidate the function of microproteins in innate immune cells by combining genetic engineering with an array of high-throughput functional assays and automated analysis pipelines.
Our research output will address key questions such as: What is the microproteome atlas in innate immune cells and how does it vary upon activation? Where are the microproteins localised and in which protein-protein interactions are they involved? What functions do different microproteins play in innate immune cells?
Understanding the role of microproteins in innate immune cells can revolutionise our understanding of the immune response at a fundamental level and open new avenues for therapeutic interventions in which new antimicrobial peptides or druggable targets could be discovered.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines
- sciences médicales et de la santé médecine fondamentale immunologie
- sciences naturelles sciences biologiques génétique génome
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2024-STG
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
901 87 UMEA
Suède
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.