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Genomic observation and perturbation: genetic modifiers to untangle disease mechanisms of RFC1 repeat expansion

Description du projet

Réparation de l’ADN et neurodégénérescence

Les neurones présentent une sensibilité accrue aux lésions de l’ADN, et la réparation de celle-ci joue donc un rôle central dans le maintien de la stabilité du génome. La protéine codée par le gène RFC1 est impliquée dans la réplication et la réparation de l’ADN. Des expansions anormales de séquences d’ADN répétitives au sein de RFC1 sont apparues comme une cause d’ataxie et de neuropathie chez l’adulte. Le projet GEMREX, financé par le CER, va mener une étude d’association pangénomique chez les individus porteurs de l’expansion du gène RFC1 afin d’identifier les modificateurs génétiques de l’apparition et de la progression de la maladie. Ils réaliseront également une étude de perturbation génique dans des neurones dérivés de cellules souches afin de confirmer la pertinence biologique de ces modificateurs. Grâce à ces expériences, combinées à l’analyse de tissus de patients et de grandes bases de données de population, le chercheur s’efforcera de délimiter les voies de la maladie et d’identifier des cibles pour de futures interventions thérapeutiques.

Objectif

Biallelic repeat expansion in RFC1, an essential gene involved in DNA replication and repair, are a leading cause of ataxia and neuropathy in the adult population.

Nonetheless, the exact mechanism linking RFC1 repeat expansion and neurodegeneration remains elusive. The prevailing hypothesis is that the repeat may lead to a partial loss of function of RFC1, by affecting expression of neuron specific RFC1 isoforms or by impairing its fine regulation in terminally differentiated neurons, including sensory neurons and Purkinje cells.

The objective of proposal is to leverage state-of the-art genomic medicine methods, including the observation of the naturally occurring genetic variation and controlled genome perturbation, to unravel disease relevant pathways.

We will perform a genome-wide association (GWA) analysis complemented by long read sequencing to identify genetic modifiers of onset, phenotype and progression of RFC1 disease. We will take advantage of the Crispri technology in genetically engineered iSensoryNeurons to further investigate the effect of GWA loci and to identify additional factors which can modulate RFC1 expression and ameliorate or exacerbate the molecular phenotype. As modifiers are likely to act at cell specific and dynamic level, genetic data will be paralleled by single-cell approaches in post mortem cerebellum and dorsal root ganglia, as well as IPSC sensory neurons and cerebellar organoids. Finally, given a high carrier frequency of RFC1 expansion nearing one out of ten people, we will try to understand whether the repeat itself can act as a modifier of common health and disease traits at population level.

The results will hopefully lead to a better understanding of disease causing mechanisms and identify potentially druggable targets. The study output may also have broader implications considering the central role of DNA repair in neuronal functioning and ageing.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.

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Mots‑clés

Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).

Programme(s)

Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants

Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme de financement

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2024-STG

Voir tous les projets financés au titre de cet appel

Institution d’accueil

UNIVERSITY COLLEGE LONDON
Contribution nette de l'UE

La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.

€ 1 500 000,00
Adresse
GOWER STREET
WC1E 6BT London
Royaume-Uni

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Région
London Inner London — West Camden and City of London
Type d’activité
Higher or Secondary Education Establishments
Liens
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

€ 1 500 000,00

Bénéficiaires (1)

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