Descripción del proyecto
Mecanismos cofactoriales en la dinámica de la transcripción
La transcripción está estrechamente regulada por cofactores que aumentan su eficacia, aunque sus mecanismos precisos siguen sin estar claros. El equipo del proyecto DYNACOF, financiado por el Consejo Europeo de Investigación, investigará cómo influyen los cofactores en la transcripción mediante experimentos avanzados de obtención de imágenes y perturbación de una sola molécula en células vivas de levadura. Mediante el análisis de la dinámica de unión al ADN y la actividad transcripcional a nivel de un solo gen, en el proyecto se descubrirán los pasos clave en la regulación de la transcripción, incluidas la cooperatividad y las propiedades de estallido bajo diferentes perturbaciones de los cofactores. También se examinarán las interacciones entre cofactores, factores de transcripción y el complejo de preiniciación para construir un modelo cinético de la transcripción. Los resultados permitirán comprender mejor la contribución de cada uno de los cofactores a la activación de la transcripción.
Objetivo
Transcription is a multi-step process involving many regulatory factors, including cofactors such as Mediator, chromatin remodelers and chromatin modifiers. Cofactors are thought to enhance transcription efficiency, but a detailed mechanistic understanding of cofactor action is still lacking. Inside single cells, the transcriptional process is highly dynamic, with regulatory factors transiently associating to DNA, and transcription occurring in stochastic bursts of high transcriptional activity, interspersed by periods of inactivity. How cofactors regulate these dynamics is so far largely unexplored. In this proposal, we aim to elucidate the molecular mechanisms of cofactor action, by combining perturbation experiments with cutting-edge single-molecule imaging techniques to measure the DNA binding dynamics of regulatory factors (input) as well as the stochastic behavior of transcription (output) in living yeast cells. First, bursting properties will be quantified at endogenous genes upon single and double cofactor perturbations to identify rate-limiting steps that are regulated by cofactors and to determine cooperativity between cofactors. Second, the DNA binding dynamics of cofactors, transcription factors and the preinitiation complex will be determined in wildtype and upon perturbations of cooperating cofactors, allowing us to construct a kinetic model of transcription. Third, building on our recently developed imaging technique, we will develop a new technology to simultaneously visualize the DNA binding of single cofactor molecules and transcriptional output at a single target locus to dissect the functional effect of cofactor DNA binding events on transcription activation. Overall, our results will provide unique insight into the composition of and transitions between transcription regulatory steps, uncovering mechanisms how cofactors increase transcription efficiency.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
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Palabras clave
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMA PRINCIPAL
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
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(se abrirá en una nueva ventana) ERC-2024-COG
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
1066 CX AMSTERDAM
Países Bajos
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.