Projektbeschreibung
Kofaktormechanismen in der Transkriptionsdynamik
Die Transkription wird durch Kofaktoren, die ihre Effizienz steigern, streng reguliert, wobei deren genaue Mechanismen jedoch unklar sind. Im Rahmen des ERC-finanzierten Projekts DYNACOF wird untersucht, wie Kofaktoren die Transkription beeinflussen. Dazu kommen fortgeschrittene Einzelmolekülbildgebung und Störexperimente in lebenden Hefezellen zum Einsatz. Durch Analyse der DNS-Bindungsdynamik und der Transkriptionsaktivität auf Einzelgenebene wird das Projektteam Schlüsselschritte in der Transkriptionsregulation einschließlich der Kooperativität und der Bersteigenschaften unter verschiedenen Kofaktorstörungen aufdecken. Außerdem werden die Wechselwirkungen zwischen Kofaktoren, Transkriptionsfaktoren und dem Präinitiationskomplex untersucht, um ein kinetisches Modell der Transkription zu erstellen. Die Ergebnisse werden zu einem tieferen Verständnis der Art und Weise beitragen, wie einzelne Kofaktorbindungsereignisse zur Transkriptionsaktivierung beitragen.
Ziel
Transcription is a multi-step process involving many regulatory factors, including cofactors such as Mediator, chromatin remodelers and chromatin modifiers. Cofactors are thought to enhance transcription efficiency, but a detailed mechanistic understanding of cofactor action is still lacking. Inside single cells, the transcriptional process is highly dynamic, with regulatory factors transiently associating to DNA, and transcription occurring in stochastic bursts of high transcriptional activity, interspersed by periods of inactivity. How cofactors regulate these dynamics is so far largely unexplored. In this proposal, we aim to elucidate the molecular mechanisms of cofactor action, by combining perturbation experiments with cutting-edge single-molecule imaging techniques to measure the DNA binding dynamics of regulatory factors (input) as well as the stochastic behavior of transcription (output) in living yeast cells. First, bursting properties will be quantified at endogenous genes upon single and double cofactor perturbations to identify rate-limiting steps that are regulated by cofactors and to determine cooperativity between cofactors. Second, the DNA binding dynamics of cofactors, transcription factors and the preinitiation complex will be determined in wildtype and upon perturbations of cooperating cofactors, allowing us to construct a kinetic model of transcription. Third, building on our recently developed imaging technique, we will develop a new technology to simultaneously visualize the DNA binding of single cofactor molecules and transcriptional output at a single target locus to dissect the functional effect of cofactor DNA binding events on transcription activation. Overall, our results will provide unique insight into the composition of and transitions between transcription regulatory steps, uncovering mechanisms how cofactors increase transcription efficiency.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
Sie müssen sich anmelden oder registrieren, um diese Funktion zu nutzen
Schlüsselbegriffe
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
-
HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
HAUPTPROGRAMM
Alle im Rahmen dieses Programms finanzierten Projekte anzeigen
Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
Alle im Rahmen dieses Finanzierungsinstruments finanzierten Projekte anzeigen
Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
(öffnet in neuem Fenster) ERC-2024-COG
Alle im Rahmen dieser Aufforderung zur Einreichung von Vorschlägen finanzierten Projekte anzeigenGastgebende Einrichtung
Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.
1066 CX AMSTERDAM
Niederlande
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.