Description du projet
Les mécanismes des cofacteurs dans la dynamique de la transcription
La transcription est étroitement régulée par des cofacteurs qui en améliorent l’efficacité, mais leurs mécanismes précis demeurent obscurs. Le projet DYNACOF, financé par le CER, étudiera la manière dont les cofacteurs influencent la transcription à l’aide d’expériences avancées d’imagerie et de perturbation de la molécule unique dans des cellules de levure vivantes. En analysant la dynamique de liaison à l’ADN et l’activité transcriptionnelle au niveau d’un seul gène, le projet fera la lumière sur des étapes clés de la régulation de la transcription, notamment la coopérativité et les propriétés d’éclatement sous différentes perturbations des cofacteurs. Il étudiera également les interactions entre les cofacteurs, les facteurs de transcription et le complexe de pré-initiation afin de construire un modèle cinétique de la transcription. Les résultats apporteront un éclairage neuf sur la contribution des événements de liaison des cofacteurs individuels à l’activation de la transcription.
Objectif
Transcription is a multi-step process involving many regulatory factors, including cofactors such as Mediator, chromatin remodelers and chromatin modifiers. Cofactors are thought to enhance transcription efficiency, but a detailed mechanistic understanding of cofactor action is still lacking. Inside single cells, the transcriptional process is highly dynamic, with regulatory factors transiently associating to DNA, and transcription occurring in stochastic bursts of high transcriptional activity, interspersed by periods of inactivity. How cofactors regulate these dynamics is so far largely unexplored. In this proposal, we aim to elucidate the molecular mechanisms of cofactor action, by combining perturbation experiments with cutting-edge single-molecule imaging techniques to measure the DNA binding dynamics of regulatory factors (input) as well as the stochastic behavior of transcription (output) in living yeast cells. First, bursting properties will be quantified at endogenous genes upon single and double cofactor perturbations to identify rate-limiting steps that are regulated by cofactors and to determine cooperativity between cofactors. Second, the DNA binding dynamics of cofactors, transcription factors and the preinitiation complex will be determined in wildtype and upon perturbations of cooperating cofactors, allowing us to construct a kinetic model of transcription. Third, building on our recently developed imaging technique, we will develop a new technology to simultaneously visualize the DNA binding of single cofactor molecules and transcriptional output at a single target locus to dissect the functional effect of cofactor DNA binding events on transcription activation. Overall, our results will provide unique insight into the composition of and transitions between transcription regulatory steps, uncovering mechanisms how cofactors increase transcription efficiency.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
Vous devez vous identifier ou vous inscrire pour utiliser cette fonction
Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
-
HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMME PRINCIPAL
Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme de financement
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2024-COG
Voir tous les projets financés au titre de cet appelInstitution d’accueil
La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
1066 CX AMSTERDAM
Pays-Bas
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.